肖特就任后，对夏威夷防御的情况作了调查，并在不长的时间里就有关战斗机与轰炸机的疏散与防护问题，给陆军副官署署长写了信，他在信中说 ：“这些飞机集中在惠勒机场和希卡姆机场，对保卫它们免受敌机攻击造成了严重的问题。”他要求为142架单引擎战斗机、121架双引擎战斗机、25架双引擎轰炸机和70架四引擎轰炸机提供地下钢筋水泥掩体防护，总共需要经费万美元。但他的这些请求没有任何结果。
3月15日，肖特就夏威夷的防空情况，又给陆军部写了一封信，他说：“关于空袭的最严重的问题，是陆海军两方面的机场对空袭的脆弱性。”
在这里，肖特已经凭直觉意识到，日本人要取得最大的成功，必须在攻击军舰之前或攻击过程中把美国空军钉在地面上。在讲清夏威夷众多的短缺之后，这位陆军将军进一步强调 ：“与美国本土大部分地方的情况相比，夏威夷的防空协调工作表现出完全不同的情景。本岛是如此之小，以至于在这里没有与本土上的警报系统相同程度的警报。在安装我们的新的监测装置之前，我们只有来自不同的岛屿的警报，只能对最危险方向约75海里的范围发出警报，以便使战斗机在最短时间内升空。”
了解珍珠港防御情况的美军高层人员，自然会表现出某种程度的不安。因为珍珠港是距美国本土几千海里之外的惟一领地，在那里美国太平洋舰队可以加油、整修和补充食物，港湾的形状大致像一朵三叶苜蓿，西、中和东海湾分别构成了3个花瓣，只能从它的细长的茎进出，那是一条长长的水道，最窄的地方一次只能通过一艘大船，因此有位美国将军把珍珠港称作“该死的捕鼠器”。
金梅尔也同样清楚珍珠港的这种对舰队的不利之处，他在上任初始就给他的上司写了一封信，要求增加珍珠港的防御兵力。但他的上司回信说：“罗斯福听到了不少水兵家属的抱怨，说他们的亲人像沙丁鱼似的被塞到战舰里，因此，总统强烈地感到人太多会使我们的舰船变得更不舒服，我们不知道如何才能使总统同意增加超过目前舰上已满员的人员编制。”
没等收到要求增加兵员的答复，金梅尔就于2月15日向他的部队发出了太平洋舰队第二号密件。密件中，金梅尔对舰队可能会受到攻击表示担心，列举了各种能想像得出的紧急情况，并附有自己兵力所允许采取的应急措施。
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偷袭珍珠港 第二部分（8）
密件的第二段声称：“负责任的世界强国，当然不会在目前条件下用进攻这里的舰队或基地来挑起战争。但是，不负责任的和被错误战略思想指导的强国，也许会进行这种尝试。”这封信进一步假设，敌人在宣战之前也许会 ：（1）偷袭珍珠港的美国军舰。（2）使用潜艇偷袭航行在海上的美国舰只。（3）上述情况同时发生。
虽然金梅尔在密件中提出了偷袭珍珠港的可能，但在当时他从内心里认为，日本绝不会故意首先发动与美国的战争，因为这几乎是可笑的。
金梅尔在密件中，规定了防卫空袭的大致分工。陆军在海军的支持下操纵海岸高射炮。舰队在珍珠港的所有部队，加上所有舰队的以瓦胡岛为基地的飞机，联合组成夏威夷的防空配系。金梅尔分配第14海军军区司令布洛克负责海军基地的防卫，并明确了他的责任。其中包括这样的告诫：“必须记住，一艘潜艇的攻击可能表明一支大型的也许由伴有航空母舰的快速舰只组成的水面舰队的存在……”
金梅尔的舰队密件，没有规定要进行远距离巡逻飞行，以保卫瓦胡岛的空中安全，这是一个不可饶恕的失误。
2月18日，金梅尔再次表示了他对他的舰队安全的担心，他在一份报告中强调指出：“我感到，对珍珠港的突然袭击（潜艇、空中或二者结合的）是可能的。我们正在采取现实可行的步骤，以使由这样的袭击所引起的损害降至最小程度，并保证使进攻的敌人部队付出代价。我们需要反潜力量和巡逻飞机……”
在这份报告中，金梅尔只写了使进攻者付出代价，而没有写如何阻止这种攻击。但他和肖特都认为，敌人的攻击更可能发生在美国军舰不在珍珠港内时。他说：“我感到，随着形势的发展，舰队也许会离开珍珠港。只有在这样的紧急情况下，敌人才有可能企图对珍珠港的军事设施发动迅速的入侵。”
金梅尔和肖特之所以这样看，是因为他们认为太平洋舰队是用于进攻的，一旦宣战，舰队的主要兵力将急速驶往各战区，并在西太平洋巡航，对日本人形成强大威慑。一旦战争开始，太平洋舰队本身的进攻行动，将是对珍珠港最好的防御。他和肖特的这种估计，与后来事情的发展恰恰相反。
为了帮助自己执行多方面繁杂的任务，金梅尔精选了一批非常聪明的军官做参谋，其中很多人，他已认识多年了。他从“布鲁克林”号的舰桥上把人们普遍喜欢的绰号叫“薄荷”的史密斯海军上校选上来，当他的参谋长。史密斯所具有的超人记忆力，使他的头脑非常机灵，他总是那么幽默，跟他聊上两句话，就像吃下一块令人兴奋的口香糖。
在金梅尔的下级军官中，与他最接近的是他的副参谋长与作战参谋迪兰尼海军上校。迪兰尼处理问题最讲究实事求是，而且他还有很高的智商。他与金梅尔有很多相似之处，包括努力工作以及对职业高度的热情。他在阐述自己的看法时，从来不管金梅尔与他的意见会不会相同。
金梅尔发掘出绰号叫“索克”的麦克莫里斯海军上校当作战计划参谋。他是个讨人喜欢的人物，能够不用擂桌子就让别人接受他的想法。对于很多海军军官来说，“索克”的大写字母签名就是一份行动计划成功的保证。
金梅尔留下了几位他的前任理查森的参谋人员，其中有麦克莫里斯的助手墨菲海军中校，理查森认为他是“美国海军中最优秀的军官”。另一位留用的是头脑敏锐的戴维斯海军中校，舰队的航空参谋，他是一名飞行员，也是金梅尔的军官中惟一的一位了解甲板起飞的人。金梅尔也留下了理查森的情报参谋雷顿海军少校。雷顿自信、机智，曾于1937年4月至1939年3月任驻日本的海军副武官，因此对日本的情况特别是日本海军的情况有第一手知识，他还能流利地讲日语。
随着理查森的去职，绰号“德国人”的柯茨海军中校希望能离开通信部门的工作，回到他所喜爱的海上。当金梅尔把他召到旗舰上，问他“年轻人，你愿意成为我的参谋人员吗”的时候，柯茨对这种讨好的询问坚定地回答：“见鬼，不！”这立即的否定让金梅尔感到吃惊，也让他感到十分难堪。“你必须服从，”金梅尔毫无商量余地说，“已经决定了。”柯茨咕哝道：“噢，见鬼！”语调完全是一种憎恶的屈从，让在场的人包括金梅尔都爆出了大笑。这样，他把柯茨也拉入了他的指挥圈子。
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偷袭珍珠港 第二部分（9）
以上几位，就是当时金梅尔参谋人员中有代表性的几位军官，这个参谋群体体现了智慧、专业知识、能力和个性的十分突出的结合。他们互相之间关系极好，互相补充，互相信任，并都具有对他们的司令官的忠诚。
每一个人在就任更高的职位后，都会发生一些变化。人们在金梅尔身上也看到了一些变化。他过去就是一位刻苦工作的人，而现在几乎对献身于工作着了迷，如果不能说超越，也可说至少是达到了献身与狂热之间的境界。只是，他在细节上花费了大量的时间，也过分地注重事物的外表。
金梅尔来夏威夷时，把妻子留在了本土。当史密斯问他“为什么没把她带来”时，金梅尔说：“喔，说实话，史密斯，我觉得当家庭在身边时不能干好工作。”他的回答让史密斯感到不好理解，因为史密斯知道，金梅尔太太的一生都是在海军中度过的，完全能够正确对待她丈夫的职务带来的各种问题。
金梅尔对自己的部下要求很严，对自己更严。他期望他的人个个高效率，而从不承认只是想干好的良好愿望。一位美国人评价：“在穿海军蓝的人中，大概再也找不出比金梅尔更有觉悟、更努力工作、更爱国和更真诚的人来了，他是很值得他的军官们对他表示忠诚的。这种忠诚是一贯的，在他生前和死后一直存在。”
金梅尔的办公室设在舰队总部大楼的二楼上。办公室设置体现了金梅尔的个性。足有300平方英尺大的房间中，令人不可思议地整洁与空荡，摆设和家具极少，一点也不装模作样，在距房间西北角不远处，有一张普通的办公桌。太平洋舰队中流传着这样的说法：你可以在漆黑之中倒退着走进金梅尔的房间，并且能够在精确指定的地方找到任何一本书、一张椅子或是一支铅笔。这充分反映了金梅尔办事情井井有条、严格精细。
担任太平洋舰队司令几个月来，最使金梅尔焦虑的问题是，他缺少实力来完成期待他完成的艰巨任务。5月26日，他发给美国海军作战部长斯塔克一份长达11页充满了攻击意见的备忘录。
他的第一个攻击矛头，刺向“稳定人员”这个巨大的难题。美国航行局前不久规定，要从各舰队抽调经过训练的人员到新建造的军舰上去服役，并且提出72％的人员来自太平洋舰队，28％的人员来自大西洋舰队。换句话说，华盛顿把太平洋舰队当作了有经验的人员的矿泉。金梅尔强烈抗议道 ：“除非按照最近调整过的各舰队的相对力量重新调整这些数字，否则太平洋舰队将被严重地夺去有经验的人员……”
金梅尔的第二个攻击矛头，刺向“航空力量薄弱”。几乎夏威夷航空的所有方面，都不能使金梅尔满意。无论是有经验的飞行员，还是分配到的飞机的数量与质量，它们的武器系统和配件，都不让金梅尔感到高兴。
第三个攻击矛头，刺向“物资供应不足”。他说：“转变物资严重不足的状况，受到两个因素的限制，一是对大不列颠的援助，二是陆军迅速地扩大……从目前形势的种种迹象看，海军也许会与良好装备的敌对力量作战，但却得不到像英国和陆军所需要的那样多的生命攸关的必需品……”
第四个攻击矛头，刺向“太平洋舰队海上兵力不足”。他指出：“随着近来派出许多最现代化和最有效力的分遣舰队，留下来完成可能会被分配的任务的舰队，是否足够与适合，就值得怀疑了。在太平洋，我们潜在的敌人离我们很远，很难够着……并且还有一个防御系统……这是一种最难克服的对立物……它要求我们具有轻型舰只和航空母舰的优势，而这些我们在太平洋又是令人遗憾的不足。我们目前的优势只是在战列舰方面，但只有在我们克服了上述不足之后，这种优势才能真正起作用。”金梅尔清楚地知道海军航空兵的价值，他从不把战列舰作为最终的武器加以依赖。他在备忘录中指出：按目前的作战计划，太平洋舰队已被无可非议地“在轻型舰只和航空母舰方面如此地削弱，以至于使它用于决定性进攻作战的能力，严重地残缺了……”
偷袭珍珠港 第二部分（10）
接着，金梅尔直接轰炸了“国家政策”。这位舰队司令官在备忘录中写道：“……我们的国家政策和为贯彻它们的外交以及军事行动，不是充分协调的。今天，任何政策都不会比用来支持它的武力更好。虽然这一点在原则上被承认了，但在实践上却明显地被忽略。我们去年夏天，把舰队留在夏威夷作为一种外交姿态，但几乎同时又派出多艘重巡洋舰去大西洋……”
随后，金梅尔提出一个解决办法：“政府的外交部门应该告诉军事部门希望产生什么样的效果，军事部门对可用的手段以及完成目的方式的判断，应有决定性的分量。”
最后，金梅尔又把火力瞄准“情报问题”。他说：“司令官……按规定不被告知政策……这已反映在目前事态和海军调动中，结果就不能估计对他的舰队可能会产生的影响。他甚至不能确切地知道他自己可用什么样的兵力，并且对严重影响他执行分配到的任务的能力的事情，没有发言权……大家都认识到，有时无论是外交的还是军事的国际事务的迅速演变，也许甚至连军事权威本身对这些事务都缺乏了解，这就会妨碍提供及时的情报。目前局势，确实是对显著的事态发展相当敏感的……”
海军作战部长斯塔克接到金梅尔的备忘录后，认为金梅尔对全局缺乏应有的理解，他感到应当把太平洋舰队司令召到华盛顿来，当面谈一谈。
接到斯塔克的邀请，金梅尔对有机会在那里面对面地与海军领导们磋商高兴得不得了，于是他带着作战计划参谋麦克莫利斯，立即起身向美国本土驶去。
6月13日，海军部长诺克斯设午宴招待海军作战部长斯塔克、太平洋舰队司令金梅尔，以及大西洋舰队司令等人。席间，大西洋舰队司令长篇赘述了他的舰队在大西洋的活动。稍后，金梅尔和海军作战部长进行了长时间的和睦的谈话。他自由地讨论了自己面临的所有困难，包括他5月26日备忘录的基本内容。
金梅尔也向斯塔克谈了珍珠港的薄弱环节，舰船、储油和修理设施的拥挤会招来攻击，特别是从空中来的攻击。还有，单一的出入水道（所有的舰船都得用它）使舰船暴露在潜艇攻击之下，并总是存在着被封锁的危险。“当舰队停在港中受到空袭或其他方式的袭击时，”他强调说，“至少需要3小时才能完成出港。”考虑了各种情况之后，他相信“惟一理想的答案，是当发生攻击时舰队不在珍珠港内”。
金梅尔这次旅行的高潮，是在斯塔克的建议下他约见总统的要求得到同意。
金梅尔与罗斯福总统会见的地点在白宫，时间是6月9日14点25分到15点50分。会谈中，两人的思想交锋是短暂的，而且次数很少，双方谈话相当平和。金梅尔对总统并不是�