鼓声擂响，湘军各部大声呼喊，发起冲锋。回民军屡次受挫，无心恋战，分部收兵回堡，隐伏不出。刘松山抓紧时间修筑军寨，安顿辎重。
刘松山做好准备之后，于9月20日率部夜袭马正和的陕西回民军，攻破十多个寨堡，追赶到吴忠堡以南。易德麟中弹阵亡，终年三十六岁。
回民军的骑兵被濠沟阻挡，无法通过。甘肃的回民军为了支援友军，都吹响号角，出寨袭扰湘军，遭到湘军反击，全部败退，仍然隐伏不出，等待援兵。
吴忠回民军等待的援军，远在南边三四百里以外。白彦虎和马生彦等人，果然率领援军，从黑城北上，进入金积堡。刘松山命令部队分路阻击，俘虏和斩杀一千多人。
这时秋禾已熟，回民军时常出堡割稻。刘松山屡次派部队拦截。马化龙又将崔三和李经举的部队召到金积堡。灵州的回民军也应调而来，黄河东西两岸的回民军精锐部队也来助战。
刘松山见回民军各路援军赶来，于10月3日命令部队发起了一次猛烈的攻击，重创增援的回民军。于是远近纷纷传说湘军已经攻克吴忠，固原的回民向北迁徙。白彦虎率部南奔固原，遭到雷正绾与黄鼎所部的夹攻，不得不放弃固原。。 最好的txt下载网
1869年，同治八年（9）
这时，清廷接到报告，说刘松山滥杀无辜，激起民变。清廷认为刘松山其人不可靠，令左宗棠催促郭宝昌部转移到榆林，负责防守陕西北部。
穆图善也上疏说，对马化龙应该安抚，不应攻击，否则会激起他铤而走险，不可收拾。
穆图善这道奏疏送达清廷时，左宗棠的捷报也送到了。清廷对刘松山才打消了一些疑虑。
金顺和张曜的两支部队在沙金托海会师，从中滩西进。已经投降的宁夏回民军再次起义，包围郡城，金顺和张曜所部日夜兼程，赶来增援。他们于10月4日抵达宁夏，回民军已撤退三十里扎营。
金顺和张曜两部于10月5日在宁夏城外攻击再次起义的回民部队，获得大胜。清廷接到山西边防的警报，令郭宝昌率部赶赴山西协助黄河的防御。
山西巡抚李宗羲素来平庸谨慎，不懂军事，依赖臬司李庆翱打理军务。左宗棠上奏，说李庆翱不可靠，清廷便催促郭宝昌率部赶赴山西。
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雷正绾等部攻克固原之后，挥师北上，于10月7日攻克黑城镇，然后回师固原。白彦虎的部队沿清水河北上，奔到黑城东南方六十里处的三营，在这里据守。
周兰亭和简敬临于10月14日率部攻克三营，斩杀回民军元帅杨文治。这支湘军继续北进，又于10月16日攻克黑城以北的李旺堡，然后继续进军，攻克穆家潭，俘虏回民军首领杨辉云。
杨文治的死讯震撼了各路回民军。马化龙多次被刘松山的部队挫败，便委托甘肃回民代他向湘军哀辞请求安抚。
白彦虎所部已经抵达预旺城。他和禹得彦、李经举等陕西回民军首领都失去了安全感，于是下令放弃预旺，率部奔向西南方的盐茶厅城，即现在地图上所标的海原。崔三、马生彦与马正和等人，全部从宁安四百户西奔，打算从打拉池南下会宁和安定，与河州的回民军会师，稍作喘息。
左宗棠令黄鼎和马德顺所部从黑城跟踪追击。两支部队于10月18日冒雪行军，于10月20日抵达盐茶厅，见堡寨上空仍有炊烟，知道回民军离去不久。马德顺率领骑兵急追四十里，在西安堡追上了回民军。停马四望，只见前面是一片平川，布满了帐篷。
回民军没料到湘军这么快追来，惊吓之下，妇女和小孩号哭奔逃。马德顺所部斩杀五六百人，黄鼎所部和呼敦的骑兵追到，又杀一千人。回民军已经散不成军。马德顺率轻骑观察地势，被埋伏的起义军刺死，哨官张显扬同时毙命。
黄鼎的部队于10月21日攻克打拉池，清廷下诏褒奖。雷正绾和黄鼎得赐上方珍玩，马德顺得到优厚的抚恤。
黄河以北的陕西回民军奔入贺兰山，张曜率部在巴彦浩特以南约五十里处的福因寺将回民军击败。阿拉善王将此事奏报清廷，清廷令金顺和张曜所部乘胜追击，又令左宗棠派部队兼顾蒙民居住地。
不久，金顺与张曜所部到达黄河以北，然后率部南下。纳万元的甘肃回民军联合陕西回民军在汉渠集迎战。金顺和张曜所部从东绕击，大败回民军。
回民军奔向纳中闸，金顺和张曜所部追赶到龙王庙以南，拔除了回民军在东南面的所有堡垒。金顺和张曜所部分别驻扎汉渠集东面和南面，捣毁四座寨堡，全歼驻守寨堡的回民军。
10月25日，黄鼎率部攻克同心以南的新堡子，陈林与马正和返奔长流水。天下大雪，雷正绾所部从同心城出击，周兰亭率部从四百户出击。陈林等人先将眷属送回金积堡，向曾传理请降。马化龙又代他们向刘松山请降。于是，雷正绾和周兰亭所部进驻宁夏北端的黄渠桥，简敬临和张福齐所部进驻韦家堡，与刘松山部会师。
在此之前，刘松山所部已经攻下顾家寨，回民军各部更加紧张。现在马化龙见禹得彦等人的陕西回民军都向刘松山递交了保证书，便托人向左宗棠请求暂缓进军。刘松山令马化龙先交出马匹和武器，再议安抚之事。马化龙交出一批朽枪和瘦马，打算应付过去。其实他命令部队昼夜修筑壁垒，挖掘濠沟。
刘松山知道这是缓兵之计，便派出营夫割草，观察马化龙所部的动静。马化龙果然派出大部队抄袭湘军，依傍敬家庄的两座寨堡列阵。刘松山命令骑兵和步兵夹击，烧毁两座寨堡。于是，吴忠的回民军趁夜掘开秦渠，逼水东流，打算灌淹湘军军营。。 最好的txt下载网
1869年，同治八年（10）
刘松山命令各部分别攻克坝西的寨堡，开挖沟渠，迫使大水西流，回民军多数溺水而亡。刘锦棠又率部攻克沟东的寨堡。
几天后，刘松山令军士们携带锄头铁锹和草束到达水漫沟，掀土填濠。回民军收兵入寨，刘松山命令步兵越过濠沟追击，攻破三座寨堡，继续进兵，攻克王庄和梁庄。
秦渠水溢影响到刘松山所部的粮食运输，来自黄河以西的运粮队都要绕道而行。王家楼和张家滩挡住了运粮队的道路。刘松山命令刘锦棠率部将这两处攻占，毁掉七座寨堡和两座壁垒。
这样一来，马化龙更加震惊。他请金积堡的汉民到湘军军营请求安抚。刘松山盘问来人，知道汉民是应马化龙的要求而来，便问道：“马化龙是否真有诚意？”汉民回答说：“我们不知道。”
刘松山无法明察马化龙的真实意图，便做好进攻的准备。他把驻防花马池和定边的四营兵力调来协助，双寿的吉林骑兵也已开到。
马化龙见湘军增兵，于10月26日派汉民到湘军营中，献出十万斤米粮。刘松山说：“必须先交出马匹和武器，才能办理安抚。说几句好话，给一点小利，是没有用的。”
于是，刘松山下令进攻金积堡旁边的七座寨堡，全部攻克。
10月31日，马化龙请求延期，暗中将灵州的眷属转移到金积堡，带领陕西的回民军入城协助防守。
刘松山获悉马化龙的计划，决定先攻灵州城。
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刘松山在11月2日命令部队夜间起床，携带干粮，分五路向灵州进军。来到灵州城南，只见到处都是水洼，最浅的地方，水都淹到马腹。
刘锦棠和萧章开率部分左右两队凫水前进，刘松山率部直捣中坚，攻克外卡。回民军骑兵从城东出兵，包抄湘军。平江人余虎恩率领骑兵左队，双寿率领骑兵右队，一同发起反击，董福祥的步兵助战。鏖战良久，回民军奔向东南。
刘锦棠和萧章开的部队已逼到城下，斩开关卡，一拥而进。回民军打开东门出城。湘军攻占灵州，并攻克城南的石垒，俘虏和斩杀二千多人，搜捕到回民军首领马元龙、马致和与郭有利等人，将他们全部处死。此外，湘军还解散七百多名汉民，缴获一千多头骡马。
当晚，刘松山留下部队防守灵州城，自己率部奔向买家庄，令刘锦棠和萧章开率部奔赴海子墩，将这些地点攻克。周边寨堡里的回民军，见到火光冲天，把天色照得如同白昼，便开门逃走。
第二天，湘军各部返回灵州，刘松山派黄万友和李树棠两营驻守。
11月4日，刘松山自己率领骑兵和步兵返回下桥，督率刘锦棠等部分别攻打里仁渠等回民军堡垒，攻下八座寨堡和两座庄子。
这时，在兰州附近的狄道境内，杨世俊部接连击败陕西的回民军，迫使回民军返回河州。黄鼎率部奔赴静宁，收抚投降的张贵所部。
左宗棠派杨世俊和徐占彪的部队分别驻防安定、会宁与静宁，省城兰州的驿路通行无阻。
雷正绾和周兰亭率部攻打中宁的张恩堡，回民军先锋袁希孟率部投降。简敬临和张福齐也率部从同心的韦州镇赶来，分兵驻扎秦渠内外，距金积堡远者十几里，近者七八里。
左宗棠见部队繁杂，担心号令不能统一，命令各部都听刘松山的将令。刘松山自从遭到非议以来，治军未曾松懈。现在金顺把刘松山所打的胜仗奏报上去，清廷下诏嘉奖他谋勇兼优，以前登记在案的举报全部销毁。刘松山终于松了一口气。
金积堡内，马化龙仍在犹豫不决，安抚一事久未定夺。
11月10日，刘松山出兵秦渠以南，进军板桥和蔡家桥，企图剪除金积堡的羽翼。不久，堡寨里号角声四起，回民军凭渠发炮。
刘锦棠等部越过桥卡，凫水包抄，将回民军击退。余虎恩和双寿的骑兵追击，骤若风雨。余虎恩被回民军戳伤左膀，坠落马下，但他立刻上马再战。回民军无法返回堡寨，守寨者望风心惊，纷纷开门向西撤走。湘军攻下三十多座村寨。
湘军的这次攻击对马化龙有了立竿见影的效果。他于当晚再次请求安抚。第二天，他代替陕西的回民军交出七十七匹战马和一百五十件枪矛。刘松山认为太少，限他在三天内全部交出。
马化龙又交出几百件烂朽的武器和几百匹瘦马，刘松山知道他还是没有诚意。这时马正和与余彦禄所部陕西回民军刚刚投降，而陈林和马长顺的回民军仍在抵抗。马化龙担心湘军发起攻击，又交出八百八十二头骡马，一千零七十件枪械。
1869年，同治八年（11）
刘松山想，人多必然心事杂，时间拖久了，必然会另生变故。他见吴忠的回民都迁走了，堡寨空着，便让愿意接受安抚的人安插到其中。不料陈林集结部队拦截，马正和也率部协助，那些已经投降的首领无法制止，局面更加不利于安抚了。
左宗棠于11月28日在泾阳接受总督官印，周开锡从福建护解军饷来到陕西。
周开锡自左宗棠离开福建后，便代理福建巡抚，仕途方始开阔。但他仍然遭到妒忌诽谤，无法再攀高峰。左宗棠听说他在福建做官，颇为艰难，便上奏清廷，请求派他的这位学生总统南路部队，穆图善仍驻扎兰州防守。清廷准奏。
周开锡的军事任务，是扼守从陕西南部通向甘肃兰州的重要通道秦州，也就是现在所说的天水。周开锡到来之前，穆图善派了几十营甘肃清军驻扎在这里，副将范铭所部本地团勇一万多人也挤在这里，兵员冗杂，不守纪律，互不买账。甘肃清军在狄道遭到挫败，士气低落，朝不保夕，将士当中，无人堪当重任。左宗棠把周开锡留下，指挥部队，兼理民事，完全可以放心了。
周开锡上任以后，在秦州兼管地方厘税和钱粮。他裁汰多余的兵员，革除陋规，开设屯田，制定课税。他把范铭和穆图善的十营部队调到巩昌驻扎，把他们孤立起来，使那些军爷无法捣乱。
这时崔三邀请狄道与河州的回民军出兵作战，穆图善派傅先宗所部将回民军击败。杨士恭的回民军联合陕西回民军援应纳王各寨，金顺与张曜所部在宁夏发起攻击，接连获胜。
左宗棠于12月3日移驻平凉。
刘松山认为金积堡回民军的情况难以判定，于12月5日约定雷正绾、张福齐、简敬临和周兰亭一起率部攻击。适逢金运昌率部从灵州赶来，湘军各部在金积堡周边集结。
各路回民军见湘军将要发起猛攻，纷纷从金积周边的寨堡出兵阻击。于是刘松山下令拉宽战线，回民军的步兵一见这种阵势，都往后退缩。刘松山命令骑兵和步兵进行夹击，回民军大溃，湘军攻下二十多座寨堡。
12月10日，刘松山令部队修筑新垒，逼近回民军，一边攻击一边修筑。金积堡的回民军大为惊慌，连夜迁徙到东西两面的各个寨堡躲避，傍靠波浪湖修筑长约三里的长墙，以图固守。
12月11日，刘松山约好各部攻击长墙，将长墙捣毁。简敬临打算与刘松山会师，绕过波浪湖，从回民军的壁垒间穿插而过，被回民军重创，简敬临战死。
12月14日，回民军再次修筑长墙，从金积堡外濠向东延伸，长约三里，又向南延伸到波浪湖，长约一里。
12月15日，刘松山指挥部队突击长墙，回民军殊死抵抗，击毙提督李就山和湘军官兵三十八人，湘军二百四十六人负伤。
12月16日，回民军继续傍湖修筑长墙。
12月17日，刘松山的部队会同金运昌所部攻打长墙西北部，刘锦棠等部攻打东北部，捣毁长墙。
12月19日，刘锦棠和萧章开所部攻打各庄炮台，全部攻破。
与此同时，其他湘军部队也在金积堡以南的同心一带，与回民军发生战斗。
当雷正绾、周兰亭、张福齐和徐文秀的部队移攻金积堡之后，左宗棠认为平凉、固原、庆阳和泾州一带千里空虚，命令周绍濂分兵驻扎黑城、李旺和同心各堡，命令桂锡桢的骑兵驻扎四百户，命令丁贤发部从镇原开到固原，命令魏光焘和刘端冕所部从庆阳与合水前进，形成犄角。
马光明率领回民军从固原东北沿清水河向西北方推进两百多里，奔向同心城，被桂锡桢的骑兵击退。马光明又率部长驱东进两百多里，夜袭洪德城，魏光焘部从环县北上增援。马光明下令解除对洪德的包围，赶紧撤向东