在颁布“戒严令”之后，国民党当局又制定了一系列法规条令，军事戒严和高度集权的专制独裁进一步强化。诸如“戡乱法”、“戡乱时检肃匪谍联保连坐办法”、“戡乱时期检索匪谍条例”、“惩治叛乱条例”、“台湾省戒严期间报纸杂志图书管理办法”、“台湾地区戒严期间防止非法###”、“罢工等规定实施办法”、“台湾地区戒严时期新闻杂志图书管理办法”、“动员戡乱时期新闻杂志图书管理办法”、“动员戡乱时期国家安全会议组织纲要”、“妨害国家动员惩罚暂行条例”等等，达100多种。这林林总总的“非常时期”法律，产生了两方面的影响。一方面，国民党最高当局的权力大大扩充了，根据“动员戡乱时期临时条款”，蒋介石获得了不少不受“宪法”限制的“紧急状态处分权”、“连选连任权”以及设置“动员戡乱机构”、决定“戡乱大政方针”、调整“中央政府”机构的组织与人事，并在维持原有“中央民意代表”职务终身不变的基础上，继续充实所谓“中央民意机构”等等。另一方面，台湾人民的各种基本政治权利和生活自由被剥夺得越来越少，台湾人民往往在不知不觉中就被冠以违反“XX管制办法”，依据“XX惩戒法令”，或扣上一顶“私通###”的红帽子而遭到惩处。
此外，国民党当局还对所有宣传工具实行严加管制，通过制定“出版法”，以限制新闻、出版的自由。自1951年起，规定不再进行新报纸的登记，直到1987年解除“戒严”的30多年间，全岛只有29家报纸。在“报禁”之下，岛内再无不同声音。
配合“戒严法”的实施，国民党当局在岛内实施特务统治，并且由蒋经国亲自主持，用以对付逃台之初的乱局和民众的不满。
早在1949年7月，蒋介石在高雄召开秘密会议，主导成立了“政治行动委员会”，指定蒋经国、唐纵、郑介民、毛人凤、叶秀峰、张镇、毛森、彭孟缉等人为委员，由唐纵任召集人。该机构的基本任务是：“统一所有情报工作，并使之充实强化。”蒋介石在台湾复职“总统”后，又指令成立“台湾情报工作委员会”（简称“台情会”），彭孟缉任主任委员。该机构负责协调指挥国民党党、政、军、宪、特、情机构。不久，“政治行动委员会”改为“总统府资料室”，由蒋经国一手操持，并接管“台情会”，蒋经国掌握了统治各门派情治机构的权力。至此，蒋介石原先在大陆的“中统”和“军统”两大特务组织已失去作用。“中统”改为“法务部调查局”，“军统”演化为“国防部情报局”和“军事情报局”，统归蒋经国手下。为了便于协调和指挥，蒋经国重新将各情治单位的工作范围加以明确：“法务部调查局”以负责进行社会调查、防止经济犯罪、贪污和漏税为主；“国防部情报局”以负责对大陆的“情报搜集”和建立特务网为主；其他情治单位以防共、防岛内“暴乱”的调查为主。与此同时，蒋氏父子还要求国民党中央党部及社会、海外青年等各部门协同情治单位工作。蒋经国遵照父旨，为“台湾存亡的必要，实施铁腕政策，只要行动可疑，经人检举，一概列入危险分子，格杀勿论”，“白色恐怖”笼罩全岛。
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“白色恐怖”席卷全岛（2）
当时台湾特务之多已发展到令人发指的地步。原来只在台湾设立一个站的“中统”和“军统”悉数搬到台湾。原来只负责搞军事情报的各军种、兵种的第二处即（情报处），此时也插手搞社会治安。再加上省保安司令部、宪兵队、警察局等，甚至连“国防部”的技术总队都抓人、办人。在有限的台湾岛，横行着“调查局”、“保密局”、“军情局”、“宪兵”、“总政战部”、“国防部二厅”、台湾省警务处等多重特务体系。为了加强控制，特务机构在各阶层、各部门、各团体遍布眼线，并在政府部门和学校中普遍设立安全室。从党政机关到中小学校，从军队系统到社会各界，特务无处不在，无时不在。七大特工系统中，仅就警察系统而言，其规模、权限就到了惊人的程度。全岛有10万多名警察，分属于台湾省警务处、20个县市警察局、87个分局、187个分驻所、12698个派出所、5027个警勤区，警察网遍布岛内各个角落。加上另外六大系统的特工人员，台湾人民随时随地处于警察和特务的监控之中。50年代初，蒋经国手下的特工已达5万人之多。警察、特务和各类情治人员占总人口比例之高、网点之密，恐怕在世界上是屈指可数的。
特务组织不仅负责查办包括共产党地下组织、“亲共分子”、“###分子”等“###”，而且负责文化检审，有权查禁书报。在经济领域，特务拥有经济管制的大权，凡有买卖金银外汇或私下贷款者，一律以“扰乱金融罪”逮捕。特务组织的各大门派，为了邀功争赏，无事生非，滥抓滥捕，屈打成招，造成大量冤假错案。更恶劣的是，由于台湾当局对特务破案有重赏，有些特务便故意引人犯罪，即当教唆犯，又当执法者，做无本发财的买卖。台湾当局规定，凡破获经济案件，告密者可得赃款30％，破案单位可得35％。于是很多特务便装成犯罪分子，如开设地下钱庄、设立赌场，或假装有外汇要抛售等，引人上钩，一旦有人落入圈套，该特务所在部门马上出面逮捕。因为告密者和破案者同出一门，落网者的赃款立即有65％落入特务之手。台湾的特务机构权力无边，无所不能，可随时插手政治、经济、军事和文教等各个领域，可以说在台湾一手遮天。
据有关材料披露，到1958年春，台湾官方宣布的颠覆案已达311320件。被捕、被传讯和受到调查者超过130万人，而当时台湾的全部人口还不到1000万人。
国民党当局逃台后，在“汉贼不两立”的观念下，更加仇视共产党，并冠之以“匪”，在岛内一再掀起“###”高潮。
为把台湾的思想文化纳入“###”轨道，蒋介石发起“文化改造运动”，发表一系列“###抗俄”文章，打着三民主义和中国传统文化的旗号，攻击马列主义。在学校、军队中灌输封建伦理道德，倡导“四维”（礼、义、廉、耻）、“八德”。在高中高职以上学校成立“中国青年###救国团”，实施“###抗俄”思想教育。狂热的“###”文化宣传遍及全岛，弥漫社会一切领域。在文学领域，国民党提倡“###文学”、“战斗文艺”。为配合“###”宣传，国民党当局还制造了一系列的“共谍案”，制造看得见摸得着的政治对立面。
为了使“保密防谍”工作更加行之有效，1950年1月27日，根据蒋介石的指示，台“行政院”颁布了《###保民总体战纲要》。纲要规定动员全岛的人力和物力，实施各种###战略。纲要还规定，台湾公民必须宣誓：“我自己绝不通匪，并不容他人通匪，如违反此誓言，愿受民众大会制裁。”4月14日，台湾“立法院”修订了“戡乱时期惩治叛乱条例”，扩大惩处范围，加重惩处标准，扩大军、警、宪、特的权力。6月13日，蒋介石下令颁布“戡乱时期检肃匪谍条例”，该条例规定：发现匪谍或有匪谍嫌疑者，无论何人均应向当地政府或治安机关告密检举。人民居住处所有无匪谍潜伏，该管保甲长或里长应随时严密清查。各机关、部队、学校、工厂或其他团体所有人员，应取具二人以上连保，如发现有图谋潜伏，连保人与该管直属主管人员应受严厉处分。治安机关对匪谍或有匪谍嫌疑者，应严密注意侦察，必要时予以逮捕。
为强化对人民群众的控制，国民党把在大陆时期所搞的“保甲连坐”制度照搬到台湾。1953年8月，台“行政院”颁布《戡乱时期检肃匪谍联保办法》，逼迫人民互相监视，彼此检举，如发现某人是匪谍，被联保者即使毫不知情，也要受到牵累。1955年6月至8月，国民党又在台湾搞所谓“在大陆被迫附匪分子总登记运动”，要求曾在大陆参加共产党的党、政、军、经济、文教、社会团体及各公私团体者，曾在共产党的工商机构、宗教组织工作过的人，曾接受过共产党的军事、政治、社团、文教、###、乡镇工作等训练的人，曾受共产党直接利用或“附匪分子”间接利用的人，都要到保安司令部办理登记。用当时台湾省主席严家淦的话说“凡是匪谍以及态度不暗不明、模棱两可的人，都将视为危险人物，必定要予以清除”。
由于国民党当局颁布的登记标准本身就是“灰暗不明、模棱两可”，因此谁有“嫌疑”，完全由特务胡乱判定。当时有些情况荒唐到了令人啼笑皆非的地步。如《时事杂志》的创办者童轩孙本人以及所办公司的经理、会计、职员一起被捕，询及原因，竟然是因为特务从他家抄出一本《汤姆·索亚历险记》，特务们居然把作者马克·吐温误看成为马克思。又如后来获诺贝尔奖的李政道先生的母亲张明璋，仅因家中留宿一位广西大学时期的同窗，便被扣上一顶“掩护匪谍”的帽子，被捕入狱。诸如此类例子，多如牛毛，举不胜举。1950年5月，蒋经国宣布已破获匪谍80余个单位，其中仅“苏艺林案”就逮捕100多人。曾担任过台湾行政长官与浙江省主席的陈仪，总参谋次长吴石中将、第4站总监陈宝仓中将、陆军聂曦上校等，也均因牵入不同的“通共”案件而被处决。
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“白色恐怖”席卷全岛（3）
江南著《蒋经国传》中曾这样记载50年代初的台湾：“翻开1950年前半年的《中央日报》，‘匪谍某某等数犯，昨日枪决伏法’的标题，一周出现好几次。保密防谍的口号，透过各种传播媒介，普及全岛每一个角落，以匪谍名义送往青岛东路军人监狱、台东绿岛，或用麻袋捆扎，未经司法程序，丢进海里喂鱼的不计其数”。
“政治肃清”乌云密布（1）
国民党退守台湾后，对台湾的左派力量进行了大规模的政治清洗。在“白色恐怖”的狂潮下，一个个立志建设社会主义中国的台湾青年长啸悲歌，在大时代的汹涌浪涛中无声无息地淹没了。依据“政治受难者团体”估计，在1950至1960年的10年间，约有三四千人在“白色恐怖”中殉难，六七千人受到监禁，而且政治迫害的灾难一直持续下来，不仅左派势力受到严重打击，更有不少无辜民众受到波及。
“2·28事件”被国民党援军镇压下去后，台湾的政治气氛顿时为一片“白色恐怖”所笼罩。那些为特务利用、参加治安维持队的天真、热情的学生，首先遭到被杀害的厄运。但是，幸存下来的“台湾学生联盟”的进步学生并没有被“白色恐怖”所吓倒。据###领袖之一的吴克清说，因为他们在“2·28事件”中看到中共地下党员的献身和牺牲，认识了中国共产党，因此在“白色恐怖”中纷纷有人加入了中国共产党的地下组织，有一部分地下党员转入山区坚持游击战争。事实上，据国民党官方的统计资料显示，台湾地下党员人数，经历了一场“2·28事件”后，反而从70人急增为285人。然而，总的说来，战后台湾的###在“2·28事件”后，不得不暂时在校里沉寂下来，###的主要领导人如郭琇琮、吴克泰、陈炳基、叶纪东等人也潜入地下，参与及领导了一场更加艰巨而全新的斗争。1947年，在内地的台湾省公费生组成的“台湾同学会”，利用暑假，组织演讲团，在台湾各地开展巡回演讲，介绍大陆学生运动的情况，传播新的思想。通过这一新的启迪与鼓舞，一度沉寂下来的校园学生运动，又从1948年春天开始逐步高涨起来，到了1949年春天，也因台大和师范学院发生的“四六事件”而达到战后台湾###的高潮。但是，没过多久，这股向往“红色中国”的左翼势力就被随之而来的“白色恐怖”狂潮淹没了。
“2·28事件”后，台湾社会秩序表面上恢复了平静，实则人心仍然浮动。当时大陆局势多变，国民党政权连连败退，各地###风起云涌，台湾亦不例外，台大、师院两校学生，先后联手走上街头示威，表达对当局的不满。4月6日，台湾警备司令部出动大批军警，突然包围台湾大学和台湾师范学院，逮捕数十名从事民主宣传活动的学生，通缉若干进步人士，此事史称“四六事件”。经过“四六事件”的打击，校园和社会中的反国民党势力又被瓦解。
抗战时期的蒋介石（中）、蒋经国（左）与蒋纬国（右）1949年3月20日，台大和师院的学生共乘一辆自行车，经过中山路派出所被抓了，那时规定自行车不得载两人，警察要罚款，学生不肯，警察就把学生扣留，并转送第四分局处理。消息很快传到师院和台大，听说同学被警察抓去，要罚款又挨了打，两三百名学生去包围第四分局，要求释放学生。这一波抗议无结果后，两校学生自治会还临时开会决定，翌日发动全校罢课游行示威。
3月21日，台大学生在罗斯福路校本部集合，整队出击，师院学生也整队出发，队伍约千余人。两队会合选出十多名主席团指挥游行，并派人担任纠察维持秩序，游行队伍沿途高唱“团结就是力量”，高呼“反内战要和平”、“反饥饿提高公费”、“警察无权打人”。游行队伍抵达警察总局的大门口，静坐抗议，由主席团代表学生向局长提出五项要求，局长口头应允，以免事情扩大。这次游行请愿和平落幕，学生各自解散回校。
3月29日青年节，台北市大、中学学生联合会宣布成立“学生联盟”，决定以“结束内战，和平救国”、“反饥饿反迫害”等诉求，于当夜在台###学院操场举行“青年晚会”。国民党当局十分震惊，动用党政军警特力量，对校园内的###活跃分子严密监视。4月，台湾省主席兼警备总司令陈诚自南京抵台，下令清查学生运动主谋分子，准备抓人。4月5日，“警总”提供一份黑名单，要拘捕台大21名、师院7名领导###的学生。
4月6日半夜，“警总”决定拘捕黑名单上的�