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就在同年二月，李世民命在凌烟阁画24位功臣像，让后世不要忘记他们为大唐建树的功绩。但未出一个月，就杀掉了24功臣之一的侯君集，同时杀死李安俨、赵节、杜荷等多位大臣，不久，又杀了宰相刘洎，刘洎的才干可比之于魏征，劝谏太宗也恰如魏征。但是，李洎一无罪过，仅有人趁乱进谗，李世民未经任何调查就把他杀了。刘洎死后才两个月，24功臣之一的张亮明从高丽争战，尚不知为了什么事，就被李世民以谋反嫌疑杀死了。不久，被称之“忠悃过人”的老臣房玄龄辞他而去。
经过一阵乱杀，朝中就剩下他认为老实可靠的长孙无忌、李靖、程知节、李勣、褚遂良几个了。然而事情仍未完结，天下也未太平，那个《秘记》中要取代他李氏天下的“女主武王”仍在传言之中。
贞观二十二年六月，突然有人劾奏武卫将军李君羡图谋不轨。览罢奏章，他脑子里出现一个图景：那是在内廷的一个御宴上，君臣酒喝得很开心，太宗命各人以自己的小名为酒令。轮到李君羡，他说自己小名叫“五娘”，太宗听了大笑说：“何物女子，乃尔勇健”转念一想，李君羡的籍贯是四川武安县，又被封为武连县公，任职武卫将军，担任玄武门的守卫，小名又叫“武娘”（自我介绍幼时长的像个女孩，排行老伍，所以家里人为他取了个女孩名，四川百姓往往把俊美的女孩称娘）。他的身份中处处都是“武”（五也是武的同音），联系《秘记》中“女主武王”的谶语，认为就应在此人身上。于是先下令逐出京师，出为华州刺史，如今御史又告他图谋不轨，说有个叫原道信的人，自言已不食人间烟火，会术法，李君羡深敬信他，常常私下交往，鬼鬼祟祟，太宗就下令诛杀了他＇《资治通鉴》，卷199，贞观二十二年六月。＇。
把李君羡处以极刑，籍没其家之后，太宗心里的疑团仍不得解，随后便悄悄地去问太史令（太史监的长官，负责观测天象、编修历法）李淳风：“秘记所言，是真是假？”李淳风神秘地回答：“臣仰观天象，俯察历数，此人已在陛下宫中，自今日始，不过三十年，当王天下。陛下子孙，将被她杀害殆尽。”并且挑明“她就是陛下的亲属。”太宗听后大惊道：“朕如休采尽杀宫中可疑的人，应该可以避免祸恶发生吧？”李淳风回答：“天数已定，是无法违背的。真要杀起来，有王者命运的是杀不了的，而那些无辜的人却遭了殃。况且再过三十年，这人已很老了。人老了会变得仁慈，陛下的天下虽被她夺去了，但陛下的子孙会少受其害。今日如果真的杀了她，必将又会有人代替她，而代替者三十年后正当盛年，就将越发怨毒，那时陛下的子孙想逃脱一个也是困难的了”太宗听李淳风这么一说，只好不再提这件事＇《资治通鉴》，卷199，贞观二十二年“庚寅”；《新唐书》，卷204，《列传》，卷129，《李淳风传》。＇。
这些神奇而戏剧化的记述，与后来发生的事实正相符，很明显是后人的编造，不会是历史的真实。如果李淳风真的算出来了，后宫里姓武的妻妾才人等，一下子就可以推导出是武则天来，以唐太宗的性格和作风，李淳风再怎么吓唬他，什么杀了还会有一个更厉害的生出来，他也不会听的，他一定会率先杀死30年后夺他天下的武氏女人，那个武卫将军李君羡是在滑稽的玩笑中就被他杀掉了。一个将军难道就比不上一个小小妃嫔宫女吗？如果真有天命，李君羡也在天命之中，既然天命难违，李君羡也是杀不得的，也只能“听天由命”，认其自然，反正天命都已安排好了，又去主动干预、杀人做什么呢？
许多文艺性的作品，或说自己的史学著作如何真实的作者，既写了李淳风与唐太宗的对话，仍觉不过瘾，接着又去写唐太宗找到了武则天，要向她开刀了。
于是，多种作品（这里不包括历史小说）的作者根据自己想象，编出了各种不同的情节来。有的描述：太宗命武则天同他下棋，幕后埋伏了甲兵刀斧手，以掷杯为号杀武则天。后来杯子掷出被武则天接住了，武则天又假意夺剑自杀，又亲自掷杯引出甲兵武士。太宗同情她、佩服她，最终承认自己错了，表示永远也不杀她，还“彻夜翻腾，前嫌尽释，和好如初”。
有的作品这样描述：唐太宗在近乎弥留的状态下，下决心杀死武则天，为大唐江山除此一害。武则天同李治一同到得太宗的病榻前，唐太宗与武则天的对话主要围绕着临幸问题，唐太宗表示故意未曾施恩于她，所以武则天必然恨他，恨他所以要杀她。而武则天极力表示皇帝对她施以重恩，临幸哪怕只有一次，也令她终生受用不尽，以此逃避被杀。最后，太宗还是要杀她，她说等皇帝“龙驭上殡（应是宾——引者），臣妾宁愿在柩前自尽，以身殉主”但太宗不同意，让她马上就死。于是她马上行动，去投缳自尽。武则天的行为又便太宗不忍，于是有了令她落发为尼，到感业寺出家的结局。
即使是编写小说故事，也要符合情节逻辑发展。首先，事实上不会有李淳风的那些惊心动魂的预言。如果安排了那个预言情节，太宗又相信了那些预言，那么杀了一个武则天还会再生出个更厉害的来，就会把太宗的子孙杀绝，那太宗就不再敢杀武则天。什么埋伏刀斧武士之类，杀一个小小女子，哪用得这般兴师动众和密谋策划。
既然《资治通鉴》这般正史上也言之凿凿，大写《秘记》之事，可能历史有点传说，也多属事后的编排，不会在太宗晚年就出现。即使当时就有此传言，也不会那么具体、生动。否则，太宗绝不会放过武则天的。当时的朝廷斗争是十分残酷的，历代皇帝为保住一姓社稷，往往大杀臣子；父子、兄弟相残的事也屡见不鲜。武则天在宫中那么多年，耳闻目睹那些血腥的事实，肯定让她心惊胆寒。从唐太宗大杀功臣、皇子们互杀争夺皇权的事实，给她很多启示。后来她当政后也学会了这么做，而且比唐太宗还要残忍。但是，《秘记》谣传时她只是一个小才人，她无依无靠，生命孱孱。如果真有史书凿凿叙述的那般具体和耸人听闻，武则天是难逃劫数的。
唐太宗与他的兄弟们相比是个强者，在夺取皇位承继斗争取得胜利。唐王朝在他的统驭下，立下了牢固的根基。中国历史也给他很高地位，“贞观之治”也是历史事实，他不愧为一代明君。
而李治在李世民的诸子中却是个弱者，因为弱他不敢与兄弟们争帝位，而帝位却由他坐上去。历史和李世民开了个很大的玩笑，但历史本身却是认真的演进：弱者太弱，当不了家就必然有强者补充、取代，这不给了武则天机会。武则天既不姓他，又不是男人，但她却是有资格当皇帝的强者。两强相抗勇者胜，何况武则天本就是强者呢。因此，历史是认真的，客观规律也是如此的，历史的正确选择也是如此。如果李治像父亲一样的强，怕是没有武则天当皇帝的份了，怕是连皇帝的妻子都当不成，因为连老皇帝太宗都没有真正让她做妻子，只让她做了十几年的侍女。
唐太宗不想让历史开他的玩笑，所以他便认真地培养儿子、严格地选拔他的接替人，期望下一代再出个李世民，子子孙孙都像他一样强，李氏江山就可以万年不替了。
立嫡玄长是我国立皇储的家法，这么做就是省得皇子间火拼，老2、老三靠边站，你既然不先出生，就让哥哥做皇帝。然而唐太宗自已都是老2，他却是杀了哥哥和弟弟，硬是夺个皇帝位做。因此，唐太宗选皇储是要个强才，如果能把老大培养成强者和勇者，就更好、更顺理成章了。然而事实偏不按他想的做，他的长子、次子都很差，甚至很坏、无恶而不为，出了格的不肖之子。
长孙皇后是一位让太宗、让诸臣们敬佩的皇后，他为太宗生了承乾、李泰、李治三个儿子。李世民心得意满，对三个儿都很疼爱。承乾7岁时太宗即位，按照礼法，把承乾立为皇太子。
承乾刚为太子时聪慧过人，太宗看到后继有人，十分喜爱他。为他配备最好的老师和辅佐，精心教导、帮着他做好太子。为高祖守孝期间，他让太子处理政务，锻炼太子的能力。太宗每次出京，就让太子监国，好像好的都满好。于是，太宗就在朝廷群臣面前表扬他，树立他的威信。便承乾长大后，却越来越堕落，喜好声色游猎，净做些缺德胡闹的坏事。他私养罪犯，让他们偷盗百姓的牛马，在东宫制造特大的炉鼎，烹煮后大吃大闹。他依照突厥人建穹庐，让手下人都穿突厥服；他还扮演突厥王的丧礼，自己直挺挺的躺在地上，众人围着号哭、奔跑、用刀割破脸。他率领猎队横冲直闯，破坏农田，挠害民生。他作风糜烂，还私养娈童，狎昵放荡等等不一而足。
太宗派来的东宫的教导者孔颖达、于志宁、张玄素等都是当代的硕儒。他们对太子百般劝谏，承乾表面很恭敬，背后去暗害。张玄素苦心劝谏，太子派人蒙面堵着他打个半死；于志宁劝谏更惹他恼怒，便派人潜入于的家暗杀他。
太宗的二儿子李泰已封魏王，是个阴险而有心计者。他见哥哥失德，已被父亲厌恶了，就自立德名博得父宠，以谋东宫太子位。他假意屈尊下士，招揽人才，以供谋位之使。李世民见魏王泰喜爱文学、礼贤下士，果然很高兴。贞观十二年，他网罗的文士们让他编写《括地志》，一方面大量聚集力量，另一方面以此取得太宗的好感，在朝中造成声望。他们的举措成功了，贞观十五年《括地志》完成，呈献给太宗，太宗十分欣喜，给了大量奖赏，每月给李泰的钱物，大大超过了东宫，还让他移居武德殿，直到魏征、褚遂良上疏劝谏，太宗才停止再拔高魏王之举。
魏王既立定争夺储君的主意，便抓紧进行，把附马都尉柴令武、房玄龄之子房遗爱、黄门侍郎韦挺、工部尚书杜楚客拉入魏王幕。这些人都在暗中结交朝臣、行贿、准备逼迫太宗立李泰为太子。
承乾明知李泰在做夺储的勾当，但自己的恶习难改，仍然胡闹下去。还对周围的人说“我当太子后就随心所欲，谁敢劝谏我就杀谁，杀他个五百人，就没有再敢劝谏了”
夺太子位就是夺天下位。既然战幕已拉开，宫中大臣必然也有所倾向，站到太子这边的也有一批人，如太宗庶弟汉王元昌、吏部尚书侯君集、中郎将李安俨、洋州刺史赵节、附马都慰杜荷等，都被太子收买，打算谋反，直接向太宗逼夺帝位。
李泰和承乾尚未发动，太宗第七子、齐王祐却率先造反。这因为李祐的性格和所作所为极像太子承乾，太宗知道后要把他交刑部处治。所以他首先公开传檄起兵造反。贞观十七年三日，太宗派兵部尚书李世勣等率九州之兵讨伐很快便镇压了李祐的反叛。
李承乾听说李祐在齐州造反后，对自己的手下说：“我宫西墙，去大内（指宫殿）只有二十步耳，与卿等举大事，远非齐王可比。”谁知再审问李祐谋反案件时，牵连到李承乾的部下，接连提审后，其部下把李承乾谋反的内幕全部抖了出来。太宗便让长孙无忌、房玄龄等重臣会同刑部查纠，果然证据确凿。太宗大怒，废太子为庶人、杀汉王李元昌、侯君集等同党。
太子被废后，马上得立新太子。当时太宗打算立魏王李泰，但却遭到长孙无忌的坚决反对。他为什么反对？史学家们在这个问题上是十分敏感的，这是关系社稷的大事，也是关系当朝大臣未来命运的大事；当朝大臣更是敏感，不能说错任何一句话。因此，史学家们大都认为长孙无忌就是要立一个软弱的太子，将来易于控制，最少也易于自保。实则，太宗那么刚强，他们不也陪伴其始终吗？长孙是一位忠贞于唐室的老臣，为相十几年，是朝前中首辅，又是国舅，太宗的三个嫡子都是他的亲外甥。他有说话的充分资格，也能持正，他反对立魏王，就是看到他在争储君时表现的阴谋、奸诈，实在不堪为人君。
太宗仍坚持，他向大臣们说：“昨青雀（李泰的小名）投我怀云：臣今晶始得为陛下子，乃更生之日也。臣有一子，臣死之日，当为陛下杀之，传位晋王。人谁不爱其子，联见其如此甚怜之。”＇《资治通鉴》，卷197，贞观十七年四月。＇褚遂良听完后奏称：“陛下以为可怜，臣实认为可惧，试想陛下万岁后，魏王据有天下，其会杀其爱子，让位给晋王吗？陛下要立魏王，以魏王杀子之言观之，必得安置好晋王，免遭其先杀之。”
褚遂良之言，实长孙未忍出口之言。魏王奸诈、残忍、狼子心腹昭示。太宗勃然变色，在众臣面前大失其态，哭着说：“朕实在做不到啊”
魏王生怕晋王李治被立为太子，就去吓唬他说：“你一向与汉王好，如今汉王与李承乾一同谋反被杀了，你就不怕受到牵连吗？”李治胆小怕事，在兄长们争夺太子位的血腥中，他生怕躲之不及，听李泰一说，吓个半死，整天心惊胆战、愁眉不展。太宗见了就问他：“怎么了，忧心忡忡的样子？”李治老实，只好吞吞吐吐说出李泰吓唬他的事。
太宗一听，猛然觉醒：“李泰的心思如此深啊”他又突然想起承乾临废言：“我已是太子了，已无所求，是魏王逼着我，为自保才做出了错事，若让李泰当太子，儿臣死了也不安心”于是，最终决心立晋王李治为太子。
随后召诸大臣至两仪殿，向大家说：“儿子们做出这等事来，真是�