路追入关中，至陈仓，大败延岑。
刘嘉和延岑皆入关中，汉中空虚无主，蜀帝公孙述趁机遣大将侯丹攻克南郑，吞并汉中全境。
刘嘉见汉中根据地失守，火速回军，与侯丹大战，大败。刘嘉既失汉中，无奈之下，只得重返关中。
至此，战乱频仍的关中，又挤进来了两支强大的流浪武装——刘嘉、延岑。
延岑自从被刘嘉击败之后，率众向东转移，屯于蓝田，离长安仅有百里。邓禹大喜，以为是送上门来的软柿子，不捏白不捏，遣大军前往蓝田，大战延岑。
然而，邓禹远远低估了延岑的战斗力。两军交战，邓禹大败，退保长安。延岑并不穷追猛打，而是进兵杜陵，休养士卒不提。
邓禹的噩梦这才刚刚开始。接着又有赤眉军的卷土重来。
赤眉军离开长安之后，一路横行，望风披靡。然而，一旦西入天水，便遭遇到割据西北的军阀隗嚣。隗嚣经营西北已久，兵强马壮，正愁没仗打，面对号称百战百胜的赤眉军，丝毫不惧，亲率大军迎击。赤眉军大败，落荒而逃。隗嚣不依不饶，一路狂追，连战连胜，一直追至乌氏、泾阳，这才收兵而返。
和隗嚣一战，乃是赤眉军在关中的首次败仗，又连遭隗嚣追杀，心态已成惊弓之鸟。即使隗嚣已经收兵，赤眉军依然恐慌不止，继续狂逃。逃至阳城，天降大雪，深坑巨谷，皆为大雪填满。赤眉军士卒平时只知道抢金银珠宝，却忘了多抢些衣服，近半数士卒活活冻死，然而也顾不上掩埋，弃尸原地，余众继续往长安玩命地奔逃。
长安之西及之北，乃西汉历代皇帝陵寝，计有汉高祖刘邦与吕后合葬之长陵、汉惠帝之安陵、汉景帝之阳陵、汉武帝之茂陵、汉昭帝之平陵，等等。
赤眉军回军长安，途经以上陵寝，刚刚死里逃生，马上贪念再起，开始大肆挖掘皇陵，盗取宝货。
邓禹自从被延岑击败之后，士卒厌战，加以粮食匮乏，士气越发低落。邓禹在长安休兵养卒，再也不敢主动发起进攻，只想守住长安即可。然而，赤眉军挖掘西汉皇陵，邓禹却又不得不救。皇陵中埋葬的都是刘秀的祖宗，邓禹如果坐视赤眉军挖开这些皇陵，日后根本无法向刘秀交代，不得已，邓禹只得率领疲惫不堪的士卒，硬着头皮向赤眉军开战。
赤眉军虽然已是元气大伤，无奈邓禹同样也是士卒饥疲，军粮断绝，每人每天只能吃到一小把枣菜。两军交战，邓禹再度大败，长安已是空城，逃回长安已无意义，邓禹无奈率败军向西退入云阳，休养兵马，寻找食物。
邓禹一去，赤眉军发掘皇陵再无阻挠，想咋挖就咋挖。
西汉盛行厚葬，皇帝陵寝的财宝之多，更是骇人听闻。以汉武帝的茂陵为例，汉武帝每年抽出天下贡赋的三分之一用来修陵，前后修建时间长达五十三年，其奢侈富丽可想而知，等汉武帝正式下葬时，高十四丈、方一百四十丈的巨大陵寝，早已填满奇珍异宝，无复容物。
赤眉军挖陵盗宝，已是大罪恶，随后更有一兽行，尤其令人发指。
按照西汉葬仪，凡帝王皇后下葬，皆身着金缕玉衣。按照古人的迷信观念，认为金缕玉衣有一种神奇的法力，可保肉体长存不朽。赤眉军挖开诸陵之后，竟亲眼见证了这种神奇，但凡裹有金缕玉衣的尸体，无不栩栩如生，除了眼睛闭着之外，几乎就是活人。
皇帝们是男人，派不上用场，点一把火，烧成灰拉倒。至于随葬的皇后贵妃，包括著名的吕后在内，则依然残存着生前的美丽，撩拨得赤眉军兵士们大发兽欲，轮番上前奸尸，凌辱发泄。
这些坟墓中的皇帝皇后和贵妃们，生前何等尊贵，凌驾于众生之上，要风得风，要雨得雨，死后却沦落到如此下场，任人摆布蹂躏，男的被挫骨扬灰，女的供奸淫泄欲。读史至此，可为长叹。
吾族礼仪之邦，素以孝道标榜，慎终追远，崇敬祖宗，所谓事死如事生是也。但问题也就出在这孝道上，所有的孝，只是针对自家祖宗而言。自家的祖宗，当然得神位高供，四时祭拜，至于别人的祖宗嘛，那跟咱就没任何关系了，想挖就挖，想烧就烧。
呜呼赤眉军，与其说他们丧心病狂，不如说他们再无敬畏之心。他们连自己的生命都不在意，又怎能奢望他们对生者保持起码的怜悯，对逝者保持起码的尊敬？
【No。4 临阵换帅】
公元二十六年九月，赤眉军挖完诸陵，重返长安。而随着赤眉军的重返，长安周边的局势越发错综复杂，各阵营之间，立即又展开了一通眼花缭乱的混战！
延岑屯兵杜陵，并没招谁惹谁，然而赤眉军就是看他不顺眼，遣大将逄安领大军十余万人前往攻打。
刘嘉屯兵谷口，同样也乖得很，赤眉军却同样看他不顺眼，遣廖湛领兵十八万，前往讨剿。
赤眉军精兵尽出，长安城中只剩下皇帝刘盆子和少量羸兵弱卒留守。邓禹大喜，捡漏儿的时机到了，不仅可以趁机收复长安，更能一举俘获刘盆子，于是发兵来攻长安。谢禄率师回救，与邓禹夜战于长安城中。邓禹偷鸡未遂，再度败走。
更让邓禹羞愧难当的是，赤眉军同时三线作战，只有在他身上尝到了胜利的快感，而在其余两条战线，赤眉军则被延岑和刘嘉揍得极为凄惨。
逄安攻延岑，先胜后败，死者十余万，逄安率数千残众逃归长安。
廖湛讨刘嘉，刘嘉大发神威，阵前亲手斩杀廖湛，余众溃散。
赤眉军连遭惨败，再也不敢招惹军阀，只得重操旧业，鱼肉孤苦百姓，继续以抢掠为生。然而，托他们自己的福，三辅早已被他们糟蹋得千疮百孔，白骨蔽野，城郭皆空，幸存者则聚为营保，坚守不下。赤眉军连日搜刮，一无所获，只得开始谋划东归。
刘嘉大胜廖湛，但自己也损失惨重，军中粮荒又日紧一日，彷徨在关中大地，不知该何去何从。刘秀听闻，遣使命邓禹招降刘嘉。
邓禹修书劝降刘嘉。刘嘉接书，聚众商议。李宝力主拥兵自守，且观成败。来歙怒斥李宝道：“文叔羽翼已成，必得天下，何观望之有！”
来歙，既是刘秀的表哥，也是刘嘉的大舅佬。刘嘉为汉中王，来歙随行至汉中，常在刘嘉左右，最见信用。
刘嘉闻来歙之言，叹道：“汉中已失，退无归处。今客居关中，士卒疲惫，终非长久之计。文叔与我，亲如骨肉。骨肉相残，我心何忍！不如降。”
刘嘉率众入云阳，归降邓禹。李宝虽随刘嘉而降，自恃手握雄兵，心犹不甘，倨慢无礼，浑不将邓禹放在眼里。邓禹近来诸事不顺，心中正烦躁不堪，见李宝狂妄嚣张，大怒，收而斩之。
李宝之弟李艮见长兄被杀，岂肯甘休，收李宝之军，趁夜突袭邓禹。邓禹猝不及防，仓促应战，战至天明，这才勉强击退李艮，清点部众，死伤逾万，大将耿䜣也不幸阵亡。耿䜣，耿纯之弟也。
此战过后，邓禹的威望一落千丈。邓禹刚到关中之时，关中百姓无不将他视为救星，都指望着他可以保土安民，还关中以太平。结果，邓禹先后被延岑、赤眉军暴揍，几无还手之力，内部又接连内讧，军纪已无从谈起。关中百姓从此对邓禹彻底死了心，靠邓禹不如靠自己，各郡县大姓于是皆各拥兵众，以武力自保，谁的号令也不听从。
必须承认，关中局势已经被邓禹完全搞砸。就连一贯力挺邓禹的刘秀，至此也终于对邓禹失去了耐心，诏令邓禹尽快回洛阳复命，同时任命冯异为关中主帅，拜征西大将军，接替邓禹。
在刘秀的嫡系之中，冯异的地位仅次于邓禹，邓禹失职，冯异顶上，可谓是众望所归。刘秀亲送冯异至河南，赐以天子乘舆及七尺玉具剑，面授方略道：“三辅先遭王莽、更始之乱，后又罹赤眉军、延岑之酷，百姓涂炭，无所依诉。今之征伐，不必强求略地屠城，重在平定安集。诸将非不健斗，然好掳掠。卿本能御吏士，念自修敕，无为郡县所苦。”冯异顿首受命，引兵进发关中。
【No。5 伤仲永】
邓禹入关中，是从黄河北岸过汾阴而入，然后避开长安，在长安以北一路扫荡。冯异入关中，则是从洛阳出发，过函谷关，一路直逼长安，正堵在赤眉军向东方逃窜的必经之路上。
冯异先抵弘农郡，所至皆布威信，弘农群盗称将军者十余辈，皆率众来降。冯异进至华阴，遭遇赤眉军先头部队阻击，冯异大胜，降其将刘始、王宣等五千余人。赤眉军首领樊崇等人大怒，尽起主力，前来华阴邀战冯异。
见赤眉大军前来，不下二十万人，部下皆劝冯异道：“兵法曰，归师莫遏。不如闪开一条道，让赤眉军顺利东归。赤眉军一走，取关中易如反掌。”
冯异摇头道：“赤眉军一出函谷关，马上就将威胁帝都洛阳。我等兵力虽少，也当死守华阴，将赤眉军堵在关中，绝不可使其东归。赤眉军无粮，不能持久，我等只须耗其粮食，挫其锐气，赤眉军不久必然自溃。”
冯异扼守华阴，如同一盏红灯，阻住了赤眉军东归之路。眼看此路不通，赤眉军其实完全可以改道，走守备空虚的武关，从南阳进入中原。然而赤眉军却偏偏死心眼，非要在华阴和冯异死磕不可，一定要把冯异这盏红灯变成绿灯，然后扬长而过。
再说邓禹接到刘秀诏书，起程返归洛阳，从云阳出发，过频阳，渡汾阴，入河东郡，进至安邑，再抵大阳，已到黄河岸边。只须过河向东，再有两日路程，便可抵达洛阳。
滔滔河水在前，天宽地阔，风急浪高，邓禹停马而观，忽然恸哭。
邓禹生性骄傲，甚至是过于骄傲。当初刘秀遣他入关中，拨给精兵两万，手下大将，也任由他随便挑选。邓禹心高气傲，早已成名的大将，如吴汉、耿弇等人，一个也不选。邓禹选了谁？以韩歆为军师，李文、李春、程虑为祭酒，冯愔为积弩将军，樊崇（非赤眉军首领，同名而已）为骁骑将军，宗歆为车骑将军，邓寻为建威将军，耿䜣为赤眉将军，左于为军师将军，皆是寂寂无名之辈。邓禹的潜台词就是：别看手下一群虾兵蟹将，但只要有我邓禹在，一切皆可搞定。而且，也只有选这些无名之辈，才能更显出我邓某人的能耐。
然而，邓禹终于在关中失败，而且是惨败。可想而知，一旦回到洛阳，他将再也没有机会执掌大军，从而为自己雪耻正名。他的人生形象，也将永远定格为一名耻辱的败将，被史官载入史册，供后人讥笑检讨。
这就是他邓禹的终局吗？不！他还没有回到洛阳！
此时，他手上仍有万余精兵，他还有最后一次翻本的机会，他还可以为命运作最后一搏！一胜遮百丑，他此刻最需要的，便是一场胜仗。
刘秀的诏书，已经严令他即刻返回洛阳。诏书固然不容违抗，但他的个人荣誉更须要捍卫。不管如何，他必须再挑战一次赤眉军，赢得一次胜利，为自己挽回荣誉。只要能挽回荣誉，哪怕刘秀日后治他欺君抗命之罪，他也将死而无悔。
邓禹临河涕零，部下也无不感奋，皆愿随邓禹作最后一战。邓禹于是渡过黄河，反折向西，屯兵湖县，遣使者邀冯异共击赤眉军。
邓禹和冯异的关系非同一般，刘秀落难河北之时，两人左膀右臂，共保刘秀，你生火来我做饭，你牵马来我挑担，称得上是过命的交情。冯异的弟弟冯愔谋反，邓禹顾念与冯异之私交，特意法外容情，保全冯愔之性命。邓禹就觉得，他帮过冯异这么大的忙，如今兄弟我有难，你冯异无论如何，也得帮兄弟我一把。
此时冯异已经在华阴坚守六十多天，与赤眉军前后数十战，降赤眉军将卒五千余人。所谓小刀割肉，一切都在按预定计划进行。邓禹遣使前来邀战，冯异持重谨慎，感觉邓禹之计太过贪功冒进，实非良策，回书婉拒道：
〖异与贼相拒且数十日，虽屡获雄将，余众尚多，可稍以恩信倾诱，难卒用兵破也。上今使诸将屯黾池邀其东，而异击其西，一举取之，此万成计也。〗
邓禹接冯异之回书，悒然不乐，与邓弘商议。邓弘好战，愤然道：“冯异不肯出战，是怕你抢了他的头功。咱们不管，先打了再说。”邓禹大喜道：“我也正是此意。没有冯异，咱们照样能赢。”
刘秀见邓禹不回洛阳，反而又折回关中，早知其意，大怒，命使者急携诏书，宣敕邓禹，严禁出战。诏书措辞极其严厉，曰：
〖慎毋与穷寇争锋！赤眉无谷，自当来东。吾以饱待饥，以逸待劳，折棰笞之，非诸将忧也。无得复妄进兵！〗
刘秀发完诏书，遣破奸将军侯进等屯新安，建威大将军耿弇等屯宜阳，一方面接应冯异、邓禹，一方面力求一次性解决赤眉军，敕诸将曰：“贼若东走，可引宜阳兵会新安；贼若南走，可引新安兵会宜阳。”
邓禹铁了心要与赤眉军一战，刘秀的诏书也不可阻拦。邓禹以邓弘为先锋，挑战赤眉军。赤眉军也会用计，在辎重车中装满黄土，面上则薄薄地铺上一层豆，与邓弘战而佯败，弃辎重车而走。邓弘兵士饿了多日，见了满车黄豆，更喜过见了满车黄金，一番哄抢，阵形大乱。赤眉军引兵杀回，邓弘军大溃。邓禹急忙领兵来救，冯异闻报，也迅即赶来驰援，赤眉军兵锋稍挫。
冯异虽获小胜，心中却知士卒又饿又累，实在不堪再战，于是提议休整数日。邓禹有如输红了眼的赌徒，一心想乘胜追击，笑冯异道：“冯将军何怯矣！”言罢，领兵再战赤眉军。冯异唯恐邓禹有失，无奈之下，只得率众同战。
赤眉军奋勇，邓禹与冯异大败，死伤三千余人，兵势溃散。
邓禹突出重围，随身仅剩二十四骑，无颜再见冯异，逃归宜阳。邓禹自知罪大，上书请辞大司徒，上梁侯（邓禹原封酂侯，建武二年春，改封梁侯，食四县）印绶。刘秀网开一面，免去邓禹大司徒之职，仍封梁侯依旧（古人虽然官爵并称，但从处罚上讲，剥夺爵位却远比罢官严厉。罢官还好，仍有机会东山再起，一旦剥夺爵位，类似于今日之开除党籍，几乎意味着在政治上已判死刑）。数月之后，改拜邓禹为右将军。
此后，邓禹在军事上再无建树，改以任文职为主，日后