希姆莱成立了“特别行动队”。根据最高统帅部和德国中央保安局的协议，特别行动队由党卫队、保安处的特工人员和盖世太保组成。他们的目的是用恐饰手段镇压任何企图反抗的居民，并在政治上清洗这些国家。
１９４１年，多数灭绝指令是由海德里希起草的。在这些指令里面，他尽量使用温和的词汇， 用“过筛” 、“改善健康条件”、“肃清”，去代替“灭绝”、“消灭”和“处决”这类刺眼的词语。
１９４１年５月中旬，海德里希委托盖世太保头子缪勒同最高统帅部谈判有关后方使用别动队的问题。谈判陷入僵局，陆军上将瓦格纳不支特别动队的计划。海德里希临时换人，让保安处外事局的施伦堡去干。他决心让军人们介入这个行动，免得他们到处装好人。施伦堡成功地使地方司令官同意向所属地区派遣特遣队，并向他们提供给养，服从他们联络网的支配。
接着，建立了四个别动队。它们按地理位置分布在四个地区：Ａ，波罗的海国家；Ｂ，斯摩棱斯克、莫斯科；Ｃ，基辅地区；Ｄ，南乌克兰。经过周密的人员搭配，每个行动队配备一千到一干二百人。它们再按一定人数组成特遣队。在一千多名人员中，武装党卫队成员约占三百五十人，司机、技师占一百五十人，盖世太保成员占一百人，当地招募的外国辅助警察占八十人，治安警察占一百三十人，刑警占四十至五十人，党卫队保安处成员占三十到三十五人。其余的人分别担任翻译、电报员、电传打字员、管理员和妇女工作。特别行动队的领导职务均被盖世太保人员把持，部分不太重要的职务则由党卫队保安处和刑事警察成员担任。
１９４３年６月底，特遣队准备就绪。根据希姆莱的指令，首先消灭他们最憎恨的犹太人和政党。７月份开始行动后，仅在苏联的里加一地就枪决了三万五千名犹太人。
党卫队戈特贝格将军的战况报告的统计数字很能说明问题：
敌人的死亡人数 四干五百人
游击队嫌疑分子死亡人数 五千人
德国人的死亡人数 五十九人
缴获的武器 四百九十二支枪
死者的人数和枪支的数量完全不成比例，只能说明特遣队杀害的是手无寸铁的农民。
许多人亲眼目睹了抓捕犹太人、屠杀犹太人时的情景。德国土木工程师赫尔曼·格拉伯是斯托布诺夫的一家德国建筑公司乌克兰分公司的负责人。１９４２年７月１４日夜晚，他因参观工地，滞留在那里，身临其境目睹了罗夫诺犹太区的五千名犹太人被残杀。
大约１０点钟时，党卫队带领乌克兰民兵包围了罗夫诺犹太区。周围架设了强烈的探照灯。接着乌克兰人和党卫队员分成若干小股，冲进各户住宅，用枪托击破房门，或扔进手榴弹。惊慌失措的犹太人被驱逐到门外。
格拉伯描述道：“在街上，妇女们哭哭啼啼要她们的孩子，孩子也吵嚷着找他们的父母。但是党卫队员却无动于衷，不断用鞭子抽打他们，并把他们驱赶到马路一边的货车旁。每节车厢里都塞得满满的，妇女和孩子的喊叫声、鞭子声和枪声响成一片。这些受到鞭打、驱赶和受伤的人们整夜在照亮的街上摇摇晃晃地走着。妇女们把已经死去的孩子抱在怀里，孩子们拖拉着他们已死的父母的手脚，走过大街，来到列车前……街上随处可见不同年龄的男女尸体。房门打开着，窗玻璃已被打碎。满街都是衣服、鞋子、袜子和各式帽子。在一栋房子的墙角处躺着一个不满周岁的婴儿，头颅已经被击碎，鲜血和脑浆粘附在墙上，孩子的脸部难以分辨清楚，他只穿着一件小衬衫。党卫队突击大队长皮茨司令官手里拿着一根很粗的狗鞭子在蹲在地上的犹太男子身边来回走着。
那些不幸者们一面受到驱赶，一面被塞进卡车里，押赴刑场。在荒郊野外，已挖好长长的沟渠，殉难者从卡车上下来时，凶手们不让他们看见这些沟渠。他们被强令脱光衣服，二十人或五十人一组走向沟渠。周围站着备有武器、手里拿着狗鞭子的党卫队员。有时只命令一名党卫队员朝殉难者的头部挨次开枪。当尸体堆满沟渠时，就用泥土填平。
格拉伯不忍这些人被处死，他去找军事当局，想以缺少工人为理由营救他们，但遭到拒绝。
这种大规模屠杀犹太人的事件比比皆是。四个行动队在苏联领土上杀害了约七十五万人。东欧的特别行动队得到二十个警察团的支持。这些警察团由骷髅队中的党卫队员组成。在克尔许，—个六岁的孩子被开枪打死，因为他唱了一首苏联歌曲。一个九岁的孩子被吊死在“萨何一凡泽蒂”广场上，他只不过是为自己采摘了几只杏子而已。
盖世太保在占领捷克斯洛伐克后，立即把他们的分支机构的网撒向全国，每个机构负责一个区。苏台德区组成一个特区，布拉格和布尔诺各建立一个总部办事处。捷克斯洛伐克的十五个城市各建立一个总部办事处，下设保安警察和保安处的一个地方分支机构。它同后来在法国建立的组织十分相似。
这十五个最高议会办事处由布拉格和布尔诺总部办事处领导，而总部办事处又由德国中央保安局第四局领导。由于有近四十万德意志人居住在占领区各国，所以得到各方面的情报相当容易。
斯洛伐克人民的叛徒从德国人手里得到一个“独立的斯洛伐克国家”之后，建立了自己的警察机构——“国家安全部”。这个表面上独立的机构，实际上是由盖世太保在幕后操纵。
布拉格的盖世太保头子伯梅逮捕了四千六百三十九人，其中大部分是共产党员，而后又逮捕了八干个捷克斯洛伐克的著名人士。这些人被投入集中营，几乎所有的人都死在那里。
党卫队中将、帝国总监的国务秘书弗朗克威胁捷克斯洛伐克的政治家们，说他们如果拒绝合作，就枪决两干名人质。
１９４２年５月２８日，《新日报》报道说：
布拉格５月２７日通讯：星期三上午，布拉格发生了谋杀党卫队大队长、德国副总监海德里希事件。党卫队大队长海德里希受伤，但无生命危险，凡拿获凶手者，赏一千万克郎。
海德里希当时没有死，被送进医院。因手榴弹爆炸时，皮坐垫和钢丝弹簧的碎片嵌进了他的胯骨横隔膜，坐垫的毛料填充物的纤维侵入脾脏而无法抢救致死。
一个德国历史上最大恐怖组织的统治者死了！然而，恐饰浪潮再次席卷捷克斯洛伐克。
６月９日晨，党卫队“欧报亲王”师的一个部队在党卫队中队长马克斯·罗斯托克的命令下，包围了离布拉格三十公里的乡镇利迪策。所有村民都被驱赴在一起，然后把十六岁以上的男人同妇女儿童分开。男人和青年被关在村长的谷仓里，妇女被关在学校里。凌晨，把男人和青年每十人编为一组，带到谷仓后面的地里，就地枪决。到了下午４点多钟时，已经枪杀了一百二十七人。在附近的克拉德塔矿山工作和在周围地区森林中当伐木工的十九个居民也放逮捕。他们连同七名妇女，一同被枪杀。其他一百九十五名妇女被押往拉文斯布吕克。党卫队士兵将婴儿从母亲怀中夺走。然后将她们杀死。其他九十名儿童被送往波兰的格奈塞瑙。最后，村庄被烧毁炸掉，夷为一片平地。
６月１日，德国《新日报》对此作了如下报道：
在对杀害党卫队大队长海德里希的凶手进行搜寻过程中，无可辩驳地证明，克拉德诺附近的利迪策村民帮助并支持了犯人作案。尽管他们否认参与了此事，但这一点已经得到证实。村民对待这样一种罪行的击度从对帝国的其他敌视活动中也得到证实。例如被发现的有非法文件、武器库、军用物资、电话，以及许多非法储存的配给商品。所有男人均遭枪决，妇女被送进集中营，小孩被送进一所教养院。这个村庄的所有建筑物被夷为平地，村庄的名字也被涂掉。
命令采取这个行动的人是国务秘书兼党卫队分队长卡尔·赫尔曼·弗朗克，他由此被称作“利迪策的屠夫”。他有权利不经过任何司法程序处死他认为应该死的人。
海德里希之死，成厂党卫队盖世太保杀人的理由。逮捕次数增多，速度加快。在布拉格的潘克多拉监狱有一千七百名捷克斯洛伐克人被杀害，有—干三百人死在已经变为监狱的布尔诺的科米克学校里。
党卫队和盖世太保始终为不能止住捷克人的英勇抵抗而恼火，因而进行加倍的报复。关在布尔诺监狱的二十万人中，只有五万人逃生，其余的全部被杀害。
纳粹占领期，总共有二十万五千个捷克人被关进集中营，只有七万五千人免于一死，其中二万三干人的身心受到极大摧残，以致很少有维持生命的能力。当纳粹党人撤离捷克斯洛伐克时，有二十六万人惨死在他们的统治之下。
１９４０年６月１４日，德军开进巴黎。６月１６日，。雷诺政府倒台，贝当担任总理。第二天，他在广播演说中宣称：“法国应该停止战斗。”而后，他分别同德国和意大利签订了“停战协定”，同意将法国领土肢解为“占领区”和“自由区”。贝当在“自内区”里选定维希市为首府，随即成立了傀儡政府。
希姆莱在法国依旧推行他在东欧各占领区的政策，在法国各地建立了庞大的警察机构和监视系统。海德里希根据希姆莱的策略，把党卫队兼警察高级领袖奥伯格介绍给法国政府，从而使他成为法国占领区党卫队员最高首脑。他极力劝说维希政府的警察总监布斯凯把权力交给纳粹党的头目，但遇到拒绝。不久，在戈林的干预下，陆军才同意由党卫队一级突击队大队长赫尔穆特·克诺亨博士率领一个由十人组成的保安警察小组随军进入法国。克诺亨在巴黎“罗浮宫饭店”设立了自己的总部。起初，他们的行动受到驻法德军司令施图尔纳洛尔将军及两干五百名宪兵的控制。这时候，奥伯格站出来给他撑腰，他才得以正常工作。
奥伯格忠实地追随希姆莱制订的政治路线，但也同施图尔纳格尔进行合作。他在装备和实力问题上受他领导，但在事务方面，却只听命于希姆莱一人。
奥伯格到达巴黎后，就定居在拉纳大街３２号。他本人的参谋部由两名军官哈根和贝克以及六名军士、两名女速记打字员和三名女电话接线员组成，可谓精干。
他上任伊始，便改组了他领导下的警察署。他拥有无限的权力，不仅可以动用党卫队，而且也可以动用党卫队招募来的法国人去施行镇压措施。他还有权得到那些辅助小组和半军事化小组的支援，以便更有效地制服那些危险的“小组、政党和人物”。
奥伯格把枪杀人质作为最好的镇压手段。在蒙彼利埃的玫瑰别墅里，在摩日的蒂伏利胡同和法国的大多数监狱里，在盖世太保居住的房子里，都传出被拷打的爱国者的惨叫声。
碉堡林立的“罗曼维尔集中营”开始时由国防军管理，到１９４３年６月党卫队接管了它。它被用来收容各种俘虏并成立了一种经常性的人质“后备队”，需要报复时，随时可以从中取人。
这里的俘虏被分成四到五个等级。 第一类被称为有权管理囚犯 的人。他们的人数不超过五十， 是犯人中的上层。他们被看作是反纳 粹的危险分子，尽管没有任何证据。这些人的职业大都是图书管理员、医生、厨师和担任过公职的人员。他们当中不存在人质问题。
第二类是给占领军造成破坏而被捕的人员。十五岁以下的儿童议员第二类。
第三类由政治犯和受到追踪的抵抗战士的妻子、母亲和女儿组成。
第四类是秘密被捕或被隔离的政治犯。
这四类囚犯住在旧碉堡的阁楼里， 他们每星期可以收到一封信 和几只包裹，甚至每天可以放一会儿风。
最悲惨的第五类人被关在旧碉堡的地下室里。 这些人挤在散发 着霉味的稻草库里，一片漆黑，四周潮湿得直淌水。他们不能洗衣服，不能洗脸。厕所在一个角落里，整个地方散发着令人作呕的臭气。生活上是非人的，精神上还要受到折磨，他们经常被告知迟早要被拉出去枪毙。他们是主要的人质提取处，如果数量不足时，便可用第四类中的人来补充。
枪决人质由国防军下令，但什么人作人质则由盖世太保来决定。枪决人质主要是针对对德国人的袭击和刺杀。枪决人质的数量按整个占领区发生行刺的方式、规模和次数而定。
这种用极端恐怖的手段来制止反抗的做法引起许多法国上层人物的愤怒和反对。维希政府的警察总监布斯凯就是想废除人质法令的人之一。 他不想去更多地镇压“反对德国”的活动，而是想更多地镇压“反对国家”的活动。为废除“人质法令”，他一直在同奥伯格举行谈判，讨论一项共同声明中的决定。这项声明是建立双方警察间关系的基础，划定相互间管辖范围。
可是海德里希的死亡破坏了这些谈判，一切事情都要从头开始。与此同时，那些通敌的政党，尤其是多里欧的法国人民党在报上发动了一场猛烈的攻击，并举行抗议集会反对维希政策，谴责他们软弱无能、胆小怕死，并控告布斯凯犯了保护犹太人和共济会会员的罪行。党卫队也遥相呼应，也对法国政府大肆攻击。
尽管如此，会谈依旧在进行，并于７月２９日取得了成果，《奥伯格一布斯凯条约》的草稿出世了。这个条约看上去完全是布斯凯的胜利，它明确地说明了德国警察的职权，并确定了法国警察的完全独立性，尤其是它包括一项至关重要的、可以缓和压力、特别是可以结束拘留人质的条文。条约规定，法国警察永远不把人当作人质，也不会把法国警察逮捕的人交给德国当局，成为他们报复的对象。法国政治犯只能由法国的司法部门审理和判决。只有直接进行暗害活动来反对占领军或占领当局的主犯才可以由德国警察提出要求进行判决。德国人不得把被捕者当作报复