正在绝望之际，查理大公得到了一些情报，这些情报又重新点燃了大公挽回败局的希望。原来，提罗尔边界的奥军司令劳顿将军已率军下驰，凭借优势兵力击败了拿破仑派在阿迪杰河上游的代理司令官，占领了整个提罗尔以及伦巴第若干城镇。威尼斯参议会获悉奥军取胜，鼓起勇气抛开了他们的中立立场，不仅对法国宣战，而且还煽动他们在维罗纳的党羽在当地医院惨无人道地屠杀法国伤兵。威尼斯军队越过边界，截断了拿破仑从后方获得各类补给品的路线。查理大公决定趁这机会在首都与拿破仑决一死战。
正当查理大公重整齐鼓时，维也纳宫廷却被拿破仑军队闪电般的推进吓坏了。维也纳到处都在传扬着一句话：汉尼拔兵临城下了。维也纳宫廷一片惊慌，贵重物品和重要文件已经开始运往匈牙利，奥皇弗兰西斯二世准备向法国请求议和。
拿破仑乘胜猛追，一心想把共和国旗帜插上维也纳城头。他上书督政府，希望得到桑尔方面军、蒙斯方面军以及莱茵方面军的配合和支援。但督政府批复道，他不能指望德国境内能有牵制性攻势，提及的各军均不得渡过莱茵河。督政府还告诉拿破仑他们已同意奥皇的议和请求。拿破仑不得不停止。
4月7日，拿破仑的先头部队抵达累欧本。累欧本是奥地利斯蒂利亚省的一个城市，距维也纳250公里。拿破仑写信通知查理大公，表示准备议和。他在这封意味深长的信中，充分照顾了战败者的自尊心。他写道，假如他能够签订和约的话，那他所感到的自豪将会超过由于战争胜利而得到的微不足道的荣誉。“难道我们杀害的人民还不够多吗？难道我们给可怜的人类带来的灾难还不够深重吗？”很快，查理大公的参谋长别耳加德中将和梅尔委耳特少将以军使身份来到法军大本营，他们在同拿破仑会商后提出照会，内容如下：“将军麾下，皇帝和国王陛下愿意促使欧洲安宁，结束使两大民族破产的战争。……在我们和您刚才进行的商谈以后，皇帝深信两国都有尽快结束这个灾难性战争的善良愿望。因此，他愿意缔结为期10天的停战协定。”
拿破仑作为总司令同奥军代表进行谈判。当天晚上签订了为期5天的停战协定。接着，拿破仑未等督政府派人前来媾和，便授权自己同奥地利代表谈判和约的初步条款。4月18日，签订了累欧本临时条款，战争以拿破仑的胜利而告终。
拿破仑自累欧本回师后，毫不留情地报复了出尔反尔的威尼斯。他派兵占领了威尼斯，并改组了其政府，还向威尼斯索取了300万法郎黄金、300万法郎海军物资、5艘战舰、20幅最精美的油画和500部珍贵的原稿。威尼斯的独立地位再也不存在了。
6月29日，拿破仑宣布在意大利北部以伦巴第为中心成立内阿尔卑斯共和国。在这里，他废除了奥地利的一套政府机构，组成了市政府和国民自卫军。这个仿效法兰西政体的共和国版图北平阿尔卑斯山脉，南至里米尼，西迄提契诺河，东抵明乔河。它成为法兰西有力的同盟国。
约瑟芬的背叛
拿破仑在远征意大利期间，屡屡思念到他的新婚妻子约瑟芬，他利用休战的点滴空闲给她写了一封又一封充满柔情蜜意的情书。他写道：“我没有一天不在爱你，没有一个夜晚不在默默地思念你，在幻觉中将你搂入怀抱。每当我空闲，捧起茶杯，总要诅咒那使我远离生命灵魂的荣誉感，我的心中只有你——可爱的约瑟芬，你占据了我的心。如果说我与你猝然告别，一如罗讷河的急流，那是为了能快快与你团聚。每当夜阑人寂，我就起床工作，那也是为了尽快完成我的使命，重返你的身旁。”“离开了你，我就不知道什么才是欣悦；离开了你，这世界就像是荒凉一片，我孤独地站在其中，没有任何人使我内心横溢的情感有所慰藉；你是我生活的源泉，你束缚了我的肉体和灵魂；因此，我的生活目的，乃是为了你而活着。我所崇敬的约瑟芬！若我离开你太久，我就不能忍耐。我并不是十分勇敢的人，有些时候，我也曾夸口我的勇敢，可是现在，我想着我的约瑟芬就生了病。尤其是那你不会太爱我的恐怖幻想楔入我的精神，使我发狂，使我连感受失望的勇气也没有了。我时常对自己说：人类对于不怕死的人是没有支配力的，但是如今我会为没有得到你的爱情而死，……我不能占有你的心的那一天，就是我在人世间末日的来临。”
然而，拿破仑热情洋溢的来信，并没有打动约瑟芬的心，因为她不是一个情窦初开的小姑娘，而是一位再嫁的寡妇。她嫁给拿破仑，物质需要重于精神。她一向挥金如土，前夫的去世使她的人生旅途变成了灰暗色。如今她嫁给前程似锦的拿破仑，她要在巴黎好好地享受所得到的一切。因而，她对拿破仑的那些热烈的来信，总是不理不睬，有时顶多只是写一些公式般的回信。她越是对他不诚心，他越发对她眷念。他三番五次写信请她速往前线与他相会，她以“怀孕不能动身”为借口拒绝了他。
拿破仑得知约瑟芬怀孕，激动得泪流满面。后来他获悉约瑟芬并没有怀孕，就再一次要求约瑟芬前往意大利。约瑟芬被拿破仑缠得不耐烦了，只好动身前往。
约瑟芬的到来使拿破仑欣喜万分。他们在米兰短暂相聚之后，拿破仑又上前线去了。善于交际的约瑟芬并没有感到孤独，她很快在米兰形成了自己的娱乐圈。拿破仑一面在战场上拚死冲杀，一面思念着爱妻约瑟芬，一旦得闲，便纵马驰骋，直奔米兰，奔向心爱的约瑟芬怀抱。可是，等待他的却是失望，约瑟芬走了，她到热那亚去了，因为那里有一个奢华的舞会，她在那里可以纵情狂欢。年轻的将军此时疑虑重重，内心交织着无以言状的爱与怨，他给约瑟芬写下了痛彻心肺的话语：“我终于来了，而你却走了，撇下你的波拿巴，抛弃了对你倾注全副身心的丈夫，到别处去寻欢作乐了。我曾历尽千辛万苦，在人世间种种厄恶面前，我面无惧色，处之泰然。然而，眼前的这般心境、这般痛苦与煎熬却使我一筹莫展，无以排遣。我以前何曾料到此种结果？我要在米兰一直呆到晚上9点。别管我，欢乐永远属于你，你快活，世上万物也随之欢腾，唯有你的丈夫，他在默默地忍受着孤独。”
拿破仑重又回到疆场冲杀了，而约瑟芬却与年轻的夏尔中尉开始了他们的浪漫史。夏尔年轻英俊，谈吐幽默，性格活泼。他所服役的骑兵先遣团是拿破仑在意大利的一支铁腕部队。当约瑟芬在米兰敞开她的沙龙大门时，夏尔和其他军官一道步入了这个娱乐圈，他以迷人的风度与不俗的谈吐博得了女主人的欢心。很快，他们便在一起调情鬼混，开始了频繁的接触。拿破仑没多久便掌握了约瑟芬与其亮军官的私情。于是，有一天，夏尔突然接到命令，叫他立即返回巴黎。夏尔走后，约瑟芬如失魂一般，终日心神不定。约瑟芬的背叛给拿破仑的心灵蒙上了一层阴影。从这以后，虽然他在感情上依旧眷念约瑟芬，可是科西嘉人那种不顾一切的冲动正在逐渐消失。
果月18日政变
督政府对拿破仑日益增长的权势和不断提高的声望深感不安。巴黎的督政官一方面贪得无厌地用拿破仑从撒丁王国、教皇国和意大利各公国勒索来的大量财富中饱私囊，并兴致勃勃地欣赏拿破仑掠夺来的第一流的油画和雕塑，一方面又从心底厌恶这个才华非凡、桀岂不驯的年轻将军，害怕这位年轻人的功业有朝一日会动摇自己的统治地位。督政府曾派克拉尔克将军监督并随时向巴黎密报拿破仑的行动，但克拉尔克并没有很好地完成任务，因为他很快就成了拿破仑的热心拥护者了。督政府的担心不无道理，这时候的拿破仑不再是获胜共和国的一位将军，而是一位按自己意志行事的征服者，他有更远大的理想。他住在米兰郊区豪华的蒙贝洛城堡里，围绕着他的是一批英勇善战的将领、对他言听计从的城市行政长官和意大利各国的部长们。蒙贝洛成为一座真正的宫廷。拿破仑曾得意地说：“我位于高空之中，我已看到世界在我底下流动。”他的理想是要当未来的领袖，他对法国外交官奥·德·梅利托说：“您是否设想我在意大利的胜利，仅仅是为了给督政府的那些律师们，为了给卡尔诺和巴拉斯增添荣誉？……国家需要一个领袖，一个以其功业驰名的领袖，而不是一个以其管理学说以及理想家的高谈阔论和讲演闻名的领袖。”为了实现自己的雄心壮志，拿破仑时时刻刻地密切注视着巴黎的政治动向。
1797年5月的一个晚上，拿破仑的部下贝尔纳多特将军从法军占领地的里雅斯特派来了一个急使。这名信使交给住在米兰的拿破仑一个公事包。这个公事包是从一个叫德·昂特雷格的保王党那里没收来的。拿破仑在这个公事包中发现了一个惊人的文件，那就是五百人院的主席、因征服荷兰而出名的皮什格鲁将军暗通保王党，企图帮助保王党推翻现任的督政府。拿破仑认为机会来了，他要有所行动了。
这时，巴黎的政局动荡不安。保王党乘督政府残酷镇压巴贝夫革命运动之际，又大肆活动起来。在改选元老院和五百人院的三分之一议员时，保王党分子赢得了大部分议席，给议会添上了浓厚的保王派色彩。在保王派占显著优势的情况下，督政府的政策是摇摆不定的。5个督政官中，巴泰勒米和卡尔诺反对采取坚决措施反击保王党，巴泰勒米甚至在暗中同情和支持保王党的活动。巴拉斯、勒贝尔、拉·雷韦伊埃·莱波这三位被誉为共和国三巨头的督政官虽经常开会，要对保王党下手，但最终也没付诸行动。当他们得知皮什格鲁将军站在反对派一边，并成为向共和国发动进攻的最高领导人之一时，深为不安。巴拉斯曾派在旺代省和布列塔尼省因迅速平息王党叛乱而声名大振的奥什将军来制服对方，并任命他为陆军部长，但因奥什还不到30岁，根据宪法不能担任这个要职，两院中的保王党抓住这一点大肆攻击，奥什将军不得不辞职。形势对巴拉斯一派十分危急。
拿破仑预见到保王党和共和国之间的斗争行将发生，他的朋友们催促他赶紧决定自己的立场。拿破仑考虑再三，认为现在自己的功劳还不足以支持他夺取最高权力，他决定保卫共和国，反对王政。其实，在拿破仑的心里，他早就瞧不起这个怯弱、无决断的督政府，并且作好了不能永远为督政府取得胜利的打算。但是，他更不想为波旁王朝取得胜利。保卫这个不屑一顾的督政府，无非是保卫一个能使他达到权力顶峰的政权而已。
拿破仑开始秘密地进行自己的计划。他先派自己的副官拉瓦莱特到巴黎去，作为他的正式代表，指示他不要卷入任何党派斗争，在巴黎的政治斗争中保持不岂不倚的中立态度。7月7日，他又派奥热罗到巴黎。拿破仑致函巴拉斯说：“奥热罗将军因料理私事，请假回巴黎。他将面告诸位，远征意大利的军人们绝对效忠于宪法，效忠于督政府。”拿破仑委托奥热罗带去意大利军团的请愿书，“如果你们害怕王党分子，你们可以调动意大利军团，它将迅速扫除这些王党分子和英国人。”拿破仑还送了300万金法郎给督政府，用以缓和其财政困难。奥热罗是个政治观点偏激而又好大喜功的将军，拿破仑相信他的这位将领在巴黎绝对不会无所作为的，他会替自己去完成自己想要完成的任务。这样，拿破仑自己不必在众目睽睽之下去冒陷入政治漩涡的危险，从而避免了重蹈奥什将军覆辙。
在拿破仑的支持下，共和国三巨头决定逮捕五百人院和元老院中的保王派议员。他们任命奥热罗为军事司令官，以保证计划的成功。这一行动正中拿破仑下怀。
果月17日午夜（1797年9月4日），奥热罗下令所有部队开赴指定地点，并在各桥梁和主要街道设置了大炮。拂晓时，两院大厅被包围，大批保王党人遭到逮捕，皮什格鲁将军和巴泰勒米督政官也被投进了监狱，只有卡尔诺督政官逃走了。就这样，果月18日政变没有遇到任何抵抗便完成了。
督政府胜利了，共和国得救了，节节胜利的拿破仑将军从遥远的意大利军营向督政府表示热烈的祝贺。
然而，督政府并未因此感激拿破仑，他们始终认为拿破仑是一头蜷缩着的、瘦弱的海兽，在潮水涌来时，会突然伸展出令人眩目的触须，置人于死地。他们起了一个让奥热罗来对付拿破仑的念头。
政变后的奥热罗将军被任命为莱茵方面几万大军的指挥，这位虚荣心极强的将军以为自己的地位可与拿破仑匹敌，开始趾高气扬起来。他站在督政府一边，发表了有指责拿破仑内容的声明。拿破仑愤怒异常，9月25日，他向督政府提出了辞职书：“我请求你们委派别人来替代我，批准我的辞职。政府这种可怕的忘恩负义的行为，完全出于我的意外。从此世界上再没有任何权力能使我为它服务了。我的相当地受到损害的健康情况迫切需要休息和安宁。我的精神状况也要求我在普通公民的行列中经受锻炼。在相当一段时间里，我被赋予很大权力，我在各种情况下都在为祖国的幸福服务。让那些不信奉善行并怀疑我的行为的人去说吧。我的安慰在于问心无愧和后世对我的评论。”
辞职是拿破仑的杀手锏，他知道自己对督政府的重要性。果然，尽管督政府很不喜欢这位势力不断壮大的年轻将领，但经过果月事变冲击后，他们已无力摆脱拿破仑了。他们要求拿破仑继续留在意大利军团总司令的岗位上。
坎波福米奥和约
1797年夏天巴黎政局的动荡，使得奥地利和整个君主制的欧洲政府突然兴奋起来，他们盼望着督政府和共和国被推翻，波旁王朝复辟，从而得以收复所有被法国占领的土地。但果月18日保王党的溃败使他们这些幻想破灭了。拿破仑看准时机，坚决要求督政府尽快地与奥地利签订正式和约�