四合院建造实际上考虑了水源问题。居民们通常在两排四合院之间的小巷里打眼水井，蒙语“胡同”（意为水井）一词便成为这样的小巷的代称。景山一带还曾建有供胡同使用的地下水水厂。三眼井胡同内有一口三个泉眼的井而得名，在当时就是皇家和大臣们日常的备用水源。以后，自来水开始进入四合院，但很多院落里的饮用水依然依靠惟一的公用水龙头维系。
了解四合院的人，找厕所不应是件麻烦事，因为根据八卦原理它有着固定的位置——通常建在四合院的西南角上，（旧时人们认为那里是“五鬼之地”，在那里建厕所，可以用秽物将“左青龙，右白虎”中的白虎镇住，免其进宅作乱，）掏大粪的人入院掏粪，再把粪背到胡同里，用粪车运往城外粪场。没有抽水马桶，厕所就很难完全进入房屋内部。16世纪，也就是中国的明代，英国女王伊丽莎白一世（1533—1603）的廷臣约翰？哈林顿爵士为她设计的最早的带阀门的冲水马桶，法国国王路易十四（1638—1715）也曾在凡尔赛宫中装了一个这样的“英国式”便器。在很长的时间中，抽水马桶是一种奢侈品，直到清末，中国人才最早见到抽水马桶。张德彝在《航海述奇》（1866）中描述他在天津上海间行驶的“行如飞”号轮船上见到的冲水厕所。梁实秋当年在1923年才住进有抽水马桶的楼房。但它们始终与四合院无缘。70年代开始，胡同里陆续出现公厕，来满足居民需要，但仍不实用。刘心武小说《钟鼓楼》里，曾经描写即将出国的局长张奇林，在去机场前突然内急，又怕胡同里的公厕将他的穿戴弄脏，只好“脱下大衣，又进到里屋，套上一条平时穿的裤子，换上一双平时穿的鞋”【1】，如厕之后，又原样换回来，对四合院生存状态的描摹入木三分。
从现实的角度看，布局舒缓的四合院在人口稠密的内城已经失去了平面辅展的空间。无论江南水乡，还是北方院落，中国传统民居正在大面积消失，在现代化的诱惑面前，它们竟然那么不堪一击。那种在“一张八仙大桌前端坐，目光从中堂向四周徐徐延展，咳嗽一声，四声回应，余音绕梁”【2】的温暖记忆，那种与血脉相牵的家族情感和孝悌伦理，真的要永远消失吗？如何处理四合院的两难处境呢？
华新民是呼吁原汁原味保留四合院的代表人物。这位有着四分之三法国血统和四分之一中国血统，操着一口道地的北京话的“保守派”，其祖父华南圭与父亲华揽洪都是土木工程界及建筑界的权威人士。据《三联生活周刊》的报道，她时常出没在即将消失的胡同深处，挨家挨户地访问那些院落。那些尚未搬迁的住户基本上都认识她，所到之处，总有人要她进去看看他们的院子，看能不能想办法保存下来。
她的设想是：一部分的院落，可以采取自愿原则，有些居民不愿意住在老城，那么他们与其他愿意留下的居民协商，后者以较为优惠的价格买下来。我还希望政府出面做一个城市建筑“功能转换”工作，把北京现在多余的商场转换成办公楼，把原先那些修建于五六十年代的办公楼，多数是非常结实的筒子楼搬空，改造成单元房，让胡同里转移出来的部分居民居住。这样做的好处是他们仍旧可以留在城里，现代很多古城比如希腊的雅典都有成功的先例，他们的政府就是依靠类似策略，把穷人保留在让他们有工作机会与廉价便利生活条件的内城。
菊儿胡同改造工程原貌保留了胡同内质量尚佳的四合院，而人口稠密的危房则被改建成美观实用并按照四合院格局进行围合的二三层楼群；国子监街区的整治则通过市场运作，将危房及一些厂房拆除改建恢复成四合院，使一条古街愈显古色古香。
但是，开发商们似乎更看重大规模的房地产开发所带来的经济价值，像菊儿胡同改造工程这样的小规模运作方式一度陷入了困境。
如同一次次艰难的演算，改造试点在逐步推动。2002年2月21日，北京市规划委员会负责人透露，三眼井胡同将被改建成为北京市内第一个充分体现四合院原有风韵和格局、具有仿古民居建筑特色，同时具备现代生活设施的历史文化保护区。这将是新中国成立以来北京规模最大的一次四合院群落整体改造。参与改造的一千多间房屋全部为砖木结构平房建筑，总建筑面积超过225万平方米。
此次新的四合院改造方案将保持原有胡同与建筑之间的尺度和比例关系，保持原有胡同四合院的建筑风格、建筑色彩、基本格局、艺术特点，在此基础上适当调整院落及主要建筑尺度，以适应现代人生活的功能要求。根据方案，工程将通过院落、房屋的高低错落、出入闪躲，创造胡同四合院的自然和谐氛围与历史厚重感，避免街道僵硬、建筑雷同、房屋呆板、平面缺少变化等弊端，并结合宅门、影壁、街头小景、砖石雕刻、牌匾楹联等细部设计，为三眼井历史文化保护区注入传统历史文化内涵，为其赋予生命力。
【1】 刘心武：《钟鼓楼》，第293页，人民文学出版社，1985年版。
【2】 韩少功：《暗示》，第176页，人民文学出版社，2002年版。
全书完